为Jupyter Notebook安装R Kernel

我们都知道在生物信息学领域，R语言发挥着极其重要的价值，相信大家平时进行个性化数据分析或者利用R进行工具开发时，主要用到的还是⬇⬇⬇。

也就是最经典的R语言集成开发环境，RStudio⬇⬇⬇。

但是当我们需要撰写学习笔记时，单纯的代码输入和控制台运行模式可能并不能完全满足需求。例如我们学习一个新的R工具包，在笔记撰写过程中，需要带有格式地记录包的用途和原理，源码解释，示例代码，各种运行结果，图片和引用，个人的观点与感悟等等。此时使用Markdown或者R Markdown，可以满足需求，但是就实时响应的便捷性，这里还是要推荐另一种工具，即⬇⬇⬇。

The Jupyter Notebook is the original web application for creating and sharing computational documents. It offers a simple, streamlined, document-centric experience.

Jupyter Notebook集成在了Anaconda中，通过安装Anaconda即可完成Jupyter Notebook的安装，这是最简单的方式，当然也可以单独安装。

Jupyter Notebook与Kernel交互，而默认的Jupyter Notebook是调用IPython Kernel，可通过在cmd中运行jupyter kernelspec list查看。

而当我们进入Jupyter Notebook，点击“New” ——> “Python 3”，即可调用IPython Kernel在Web端进行Python编程。当然这些对于Python用户，特别是着重数据分析与科学计算领域的Python用户，都是一些常识知识。那么如果我们想进行R编程呢？所需要的自然是安装一个R Kernel，让Jupyter Notebook可以调用它。

在R中安装devtools::install_github('IRkernel/IRkernel')，然后根据自己的R版本（我的是R 4.1.2）运行IRkernel::installspec(name = 'ir41', displayname = 'R 4.1')。（另外如果想删除安装的内核，可在cmd中运行jupyter kernelspec uninstall ir41）。

在Web端进行R编程，支持Markdown格式，Latex公式，实时响应代码输入输出，粗略的效果⬇⬇⬇：

参考：
https://github.com/ipython/ipykernel
https://github.com/IRkernel/IRkernel