【生信基础】conda 安装R和R包

conda 安装R环境，主要命令如下：

1. conda 创建R环境

  conda create -n r4

2.激活创建的环境,后面安装的包和软件都会在此环境中进行

source activate r4

3.安装所需要的包

conda install r-base=4.0.3

4.关闭此环境

source deactivate

安装完R环境后，export 相应的path，如下

cd  /Anaconda3/envs/r4/bin
export PATH="$PATH:/Anaconda3/envs/r4/bin"

安装相关的包，例如ballgown：

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")

BiocManager::install("ballgown")

注意，如果不export 相应的path，R安装包时很容易找不到相应的程序，如：
/bin/sh: x86_64-conda_cos6-linux-gnu-c++: command not found

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