2021-08-23 PICASSO——用Cas9进行素描

提起PICASSO(图1),你会想到什么?抽象画?和平鸽?不过,于我而言,那寥寥数笔勾勒出的和平鸽着实动人。闲篇少扯,今天分享的这项研究既然以PICASSO为名,想必定与之有点关系。细读下来发现主要是因为研究者巧妙的用其开发的方法(及PICASSO)绘制了一幅Picasso的素描画(图2)。


图1 Pablo Picasso
图2 PICASSO概览

图3 PICASSO流程

三言两语
1.PICASSO,一种基于dCas9的肽段展示技术,其核心原理是:在大肠杆菌中,将dCas9和肽段融合表达,同时表达与肽段一一对应的sgRNA;依次得到一个sgRNA-dCas9-肽段的文库;另外合成一张DNA芯片,上面锚定有不同的dsDNA,这些dsDNA可以被sgRNA靶向。通过将sgRNA-dCas9-肽段文库与DNA芯片孵育,将sgRNA-dCas9-肽段固定到DNA芯片上相应的靶点上。然后将拟筛选或反应物与之反应,结合DNA芯片上的座位信息即可推断对应的sgRNA信息,进而可以判断是哪种肽段可以与之发生反应。

Reference
Barber, K. W., Shrock, E. & Elledge, S. J. CRISPR-based peptide library display and programmable microarray self-assembly for rapid quantitative protein binding assays. Mol Cell (2021).

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