啊吧啊吧鸭
啊吧啊吧鸭

GEO和SRA

  1. GEO（Gene Expression Omnibus database）：是一个储存芯片、二代测序以及其他高通量测序数据的一个数据库。

  2. GPL（GEO Platform）：测序时使用芯片的平台。

  3. GSM（GEO Sample）：单个样本的数据。

  4. GSE（GEO Series ）：一个完整的研究中所使用的的全部数据，包括多个GSM。

图一

箭头从上往下依次是：芯片平台、样本编号、ENA数据库中对应的编号(有时会还会有SRA数据库对应的编号)、芯片测得的原始数据。

原始数据下载解压后如图二


图二

SRA官网
SRA介绍
SRA数据库解读

测序平台介绍

测序和芯片的区别

测序和芯片的区别

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