qiime2学习—Moving pictures

分享零编程语言基础的菜鸡在学习qiime2遇到的问题

——实战Moving pictures

附qiime2官方教学网站 “Moving Pictures” tutorial — QIIME 2 2019.10.0 documentation

我们都知道qiime2要在Ubuntu系统下运行，需要你输入命令执行每一步动作。。。好在咱们的ubuntu桌面版还给我这个菜鸡留了点操作空间

哦豁，问题来了。。。在学习人体微生物组Moving pictures这一章节时，我发现，从浏览器上下载sample-metadata.tsv文件后，通过鼠标点选进行重命名操作的话会出现问题。。话不多说，上图

1，浏览器下载文件直接重命名

对下载的原文件“Moving Pictures sample-metadata”直接重命名为“sample-metadata.tsv”

2，demux操作失败

运行日志显示找不到sample-metadata.tsv文件，这。。我刚刚明明复制进来了啊

3，既然找不到，那我用ls命令查看一下，是不是真的不存在

结果是当真没有，，在我们的工作目录下，其实没有把sample-metadata.tsv文件copy过来

4，正确的做法

首先，利用move命令，将“Moving Pictures...”文件重命名

然后，利用cp命令，把“sample-metadata.tsv”文件拷贝到我们创建的工作目录

哦豁，这下子demux操作顺利完成

接下来，就继续按照网页教程上的命令run就可以啦

5，总结

单个文件的重命名、复制最好还是用命令进行，避免像我一样一直出错。。。

ps：当qiime2的输出文件类型是qzv的时候，可以用输入指令 qiime tools view +文件名，就可以在浏览器上看到运行的结果了

qiime2学习——从菜鸡到菜鸟