2022空间转录组分析01:stLearn CCI分析教程数据说明

教程链接:https://stlearn.readthedocs.io/en/latest/tutorials/stLearn-CCI.html

教程更新速度太快,很多网络上的帖子已经不能运行了,官网教程的数据又没有提前交代。。。还没开始学习就遇到了两个坑。。。
此教程数据在:10X官网

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space ranger 1.1.0与1.0.0区别:spot数不一样,官方教程采用的是1.0.0,V1_Breast_Cancer_Block_A_Section_1/的spot数为3813个

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教程中的label_transfer_bc.txt数据在:https://github.com/BiomedicalMachineLearning/stLearn/tree/master/tutorials

关于label的来源,可见:https://github.com/BiomedicalMachineLearning/stLearn/issues

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