服务器jupyter的配置

痛苦流涕!小菜鸟历时很多很多天,今天终于成功在服务器上装上了能用的jupyter!本文十二万分感谢此篇教程:Linux 服务器上部署搭建 Jupyter notebook【详细教程】_W_nihao_123456的博客-CSDN博客

一、miniconda3的安装:清华镜像安装最新版本
Index of /anaconda/miniconda/ | 清华大学开源软件镜像站 | Tsinghua Open Source Mirror

1. 软件下载与安装

#软件下载
wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.sh
#软件安装
bash Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.sh

按照shell界面提示进行安装即可。

注意:不建议通过conda init进行初始化,因为可能会导致conda与系统里的软件相冲突

initialize

2. 启动conda 环境:(每次都需要)

source ~/miniconda3/bin/activate

3. 添加国内镜像,进入清华镜像源anaconda页面:

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda 
conda config --set show_channel_urls true

4. 更新环境

# 查看版本
conda -V
# 更新conda环境
conda update -n base conda
# 更新conda的所有包
conda update --all

注意:添加完镜像之后一定一定要更行环境,不然会出现下列报错:
Solving environment: failed with initial frozen solve. Retrying with flexible solve.

二、Jupyter的配置

1.安装jupyter

conda install jupyterlab      #安装jupyter
jupyter notebook --generate-config  #生成jupyter配置文件

该命令执行后会生成一个./jupyter/jupyter_notebook_config.py的文件,你需要打开该文件,该文件的位置基本就是在本目录,较为容易找到。

2.修改Jupyter_notebook_config.py该配置文件

c.NotebookApp.ip = ''     # 设置访问IP
c.NotebookApp.open_browser = False    # 默认不自动打开浏览器
c.NotebookApp.password = ''         # 输入刚刚生成的密钥
c.NotebookApp.port = 8888           # 设置端口, 其他端口应该也是可以的
c.NotebookApp.notebook_dir = ''     # 设置Jupyternotebook 打开的根目录

(1)上述代码c.NotebookApp.ip = ''的设置,需要你在你的linux服务器上运行ifconfig命令,可以看到一个或多个ip地址,选择一个填入即可,如我选的是 10.42.1.181


IP

(2)上述代码c.NotebookApp.password = ''的设置,需要你在服务器上依次执行如下命令:

python    #调用python
#以下是python
>>> from notebook.auth import passwd 
>>> passwd()
Enter password: 
Verify password: 
'argon2:$argon2id$v=19$m=10240,t=10,p=8$HgQc0YPTuS+ylod6fgdWXw$HKYXUwUXM7JGikCwW+kuLg'    #将这串密码保存下来,放入c.NotebookApp.password = ''里面

然后运行完passwd()之后会得到一串密码,你需要将这串密码保存下来,放入c.NotebookApp.password = ''里面。
(3)上述代码c.NotebookApp.notebook_dir = ''的设置,这里你需要在引号中加入路径即可。

执行完之后你就得到了如下的内容:

c.NotebookApp.ip = 'xx.xx.xx.xx'     # 设置访问IP
c.NotebookApp.open_browser = False    # 默认不自动打开浏览器
c.NotebookApp.password = 'xxxxxxx'          # 输入刚刚生成的密钥
c.NotebookApp.port = 8888           # 设置端口, 其他端口应该也是可以的
c.NotebookApp.notebook_dir = 'xxxxxxx'     # 设置Jupyternotebook 打开的根目录

将这些内容全部追加到jupyter_notebook_config.py文件末尾,保存文件。

三、运行Jupyter notebook

今天最令小菜鸡激动人心的时刻到了!!!

1. 运行如下命令打开Jupyter

jupyter notebook

将网站复制到浏览器中,输入刚刚自己设置的密码,就好啦!!!成功!!!


jupyter登录

2. 添加R内核

进入R shell:

install.packages(c('IRkernel','repr', 'IRdisplay', 'evaluate', 'crayon', 'pbdZMQ', 'devtools', 'uuid', 'digest'))
IRkernel::installspec() #只在当前用户安装

然后重启或者刷新jupyter就可以看到R啦!!!妈呀感动!!!


R内核

3. jupyter小组件Conda和Nbextensions
在终端中输入以下命令:

pip install jupyter_contrib_nbextensions   #Nbextensions
jupyter-contrib-nbextension install --user

conda install nb_conda  #安装nb_conda

小组件

撒花!!!

感恩以下无私分享的人儿们的分享:
Jupyter notebook中配置R语言_weixin_43659913的博客-CSDN博客
Linux 服务器上部署搭建 Jupyter notebook【详细教程】_W_nihao_123456的博客-CSDN博客

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