pybind11使用记录---ubuntu下使用cmake编译c++工程为python库


前言:

因为最近c++下的工程需要在python下调用,所以需要把c++编译成可供python调用的库,记录一下具体做法:

编译c++有多种方法,因为我的是cmake构建的工程,所以直接在cmake的基础上编译成python库(c++中用了第三方库opencv和boost)


 下载编译pybind11

下载pybind11:git clone https://github.com/pybind/pybind11.git

安装pytest: pip install pytest

编译:

cd pybind11
mkdir build
cd build
cmake ..
cmake --build . --config Release --target check

操作C++代码

我的做法是将编译好的pybind11文件夹拷贝到了c++工程目录下(这样是方便在编译c++的时候能找到pybind11,当然你也可以通过其他方式,只要能找到pybind11就行)

 (我只封装了所需要的函数接口)

将你需要的函数接口定义在一个.cpp文件中,比如说,我在pcc.cpp文件中定义了两个函数(该包含的.h文件就正常包含):

int pcc_encoder() 和 int pcc_decoder()

然后在此文件中加入如下代码:

#include 

namespace py = pybind11;
PYBIND11_PLUGIN(Pypcc) {
    py::module m("Pypcc", "pcc python module");

    m.def("pcc_encoder", &pcc_encoder, "Encoder the pointcloud data");
    m.def("pcc_decoder", &pcc_decoder, "Decoder the pointcloud data");

    return m.ptr();
}

 其中比较重要的是这两句:

m.def("pcc_encoder", &pcc_encoder, "Encoder the pointcloud data");

m.def("pcc_decoder", &pcc_decoder, "Decoder the pointcloud data");

这两句代码表明了可供python调用的函数接口,没有在此操作的函数python是找不到的

 修改CMakeLists.txt

(只需改动几处即可,第三方库的include和链接基本和c++编译一样)

PROJECT(compression)
CMAKE_MINIMUM_REQUIRED(VERSION 2.1.8)

add_definitions(-std=c++11)

find_package(Boost COMPONENTS system thread program_options) 
find_package(OpenCV QUIET)

set(LIBRARY_OUTPUT_PATH ../)

set(dso_SOURCE_FILES
    ${PROJECT_SOURCE_DIR}/src/decoder.cpp
    ${PROJECT_SOURCE_DIR}/src/encoder.cpp
    ${PROJECT_SOURCE_DIR}/src/utils.cpp
    ${PROJECT_SOURCE_DIR}/src/io.cpp
    ${PROJECT_SOURCE_DIR}/src/pcc_module.cpp
)

#add_library(pcc SHARED ${dso_SOURCE_FILES})

include_directories(
  ${PROJECT_SOURCE_DIR}/include
  ${OpenCV_INCLUDE_DIRS} 
  ${Boost_INCLUDE_DIRS}
)

add_subdirectory(pybind11)
pybind11_add_module(Pypcc ${PROJECT_SOURCE_DIR}/src/pcc.cpp ${dso_SOURCE_FILES})
#add_executable(pcc_test ${PROJECT_SOURCE_DIR}/src/pcc_test.cpp ${dso_SOURCE_FILES})
#add_executable(pcc_test ${PROJECT_SOURCE_DIR}/src/pcc_test.cpp)
target_link_libraries(Pypcc PRIVATE
  ${Boost_LIBRARIES}
  ${OpenCV_LIBS}
)

可以看到只需要修改原本文件的几个地方就可以:

set(LIBRARY_OUTPUT_PATH ../)

这个的意思是设置生成的python库的位置

add_subdirectory(pybind11)

这个是用来增加pybind11的目录,因为之前我把pybind11放在了c++的工程目录下,所以可以直接顺利找到

pybind11_add_module(Pypcc ${PROJECT_SOURCE_DIR}/src/pcc.cpp ${dso_SOURCE_FILES})

这个的意思对应于编译c++的add_executable命令,就是说把哪些文件编译成python库,Pypcc是取的库的名字

target_link_libraries(Pypcc PRIVATE

  ${Boost_LIBRARIES}

  ${OpenCV_LIBS}

)

这里是链接第三方库,注意要加上PRIVATE

 然后按照一般的c++编译步骤就可以了(进入到新建的build文件夹,执行cmake .. 再执行make),编译完成之后我们可以看到在指定目录下生成.so文件

 编写python调用文件

import Pypcc        #导入.so模块
Pypcc.XXX()         #调用模块的函数

这里说明一下:因为我的.so文件放在了和.py文件同一目录下,所以可以直接导入

 遇到的问题:

  •  因为我的.so文件是在python3.6的环境下编译的,所以python2.7环境下导入报出没有这个模块的错误,原因到底是编译c++环境的原因,还是一开始编译pybind11默认的python环境的原因?后续可以验证一下

这个问题已经解决了:

在编译自己的c++项目的时候,一般来说需要在build中先cmake ..生成makefile文件,如果在这里我们不指定python版本的时候,就会寻找到默认的python版本,比如在我的环境下执行cnake ..,有如下信息输出:

-- Found PythonInterp: /usr/bin/python3.6 (found version "3.6.9") 
-- Found PythonLibs: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libpython3.6m.so

说明此时的python版本是3.6 ,而如果我们想利用pyhton2.7(其他版本也一样,前提是系统里安装了相应的python版本或者虚拟环境),那么在cmake ..的时候就要指定python为2.7版本:在python2.7安装的位置找到库文件/头文件/可执行文件

cmake -DPYTHON_LIBRARY=/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libpython2.7.so \
    -DPYTHON_INCLUDE_DIR=/usr/include/python2.7 \
    -DPYTHON_EXECUTABLE=/usr/bin/python2.7 \
    ..

 这时候给出的cmake信息为:

-- Found PythonInterp: /usr/bin/python2.7 (found version "2.7.17") 
-- Found PythonLibs: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libpython2.7.so

 然后执行make命令,就会生成可供python2.7导入调用的库

  • 因为我需要传二维数组给这个参数,考虑到python和c++之间用纯c语言“沟通”可能会好一点,所以打算以这样的方式传参:

float points[][4]

int nums

但是在编译的时候报出错误:

cannot convert ‘pybind11::detail::type_caster::cast_op_type {aka float*}’ to ‘float (*)[4]’ in argument passing

看到有人说pybind11不支持这种指针类型???这里还没弄清楚

后面我的解决方法是使用STL vector进行传参的,c++中的STL与python是有类型对应的:

前提是要在之前的.cpp文件中包含一个头文件

#include 

pybind11使用记录---ubuntu下使用cmake编译c++工程为python库_第1张图片

  • 在c++中,一般在.h中声明一个函数的时候,可以赋给参数默认值,这样在调用的时候如果默认值的参数没有传进来,那么函数就是用其默认值,但是如果某个函数作为python接口供python调用,即使在c++中声明了默认值,python调用的时候也要将全部参数传参,否则会出现参数不匹配的错误

与opencv通信

 最近遇到的问题是希望使用Python cv2读取图片,然后将其传入到c++中处理,这实际上涉及到opencv读取图像在Python和C++中的转换问题.

在C++中读取的图片类型是cv::Mat, 这是opencv中定义的类型,使用起来很方便,在Python中读取的图片类型是numpy.ndarray类,也就是第三方库numpy的类型, 因此需要定义函数对其进行转换,这里引用了https://blog.csdn.net/non_hercules/article/details/105095153/ 的工作:

//在c++中代码中将cv::Mat与py::array_t进行转换
//py::array_t就是c++中接收到的Python传过来的图像的类型

/*
Python->C++ Mat
*/
 
 
cv::Mat numpy_uint8_1c_to_cv_mat(py::array_t& input) {
 
    if (input.ndim() != 2)
        throw std::runtime_error("1-channel image must be 2 dims ");
 
    py::buffer_info buf = input.request();
 
    cv::Mat mat(buf.shape[0], buf.shape[1], CV_8UC1, (unsigned char*)buf.ptr);
    
    return mat;
}
 
 
cv::Mat numpy_uint8_3c_to_cv_mat(py::array_t& input) {
 
    if (input.ndim() != 3)
        throw std::runtime_error("3-channel image must be 3 dims ");
 
    py::buffer_info buf = input.request();
 
    cv::Mat mat(buf.shape[0], buf.shape[1], CV_8UC3, (unsigned char*)buf.ptr);
 
    return mat;
}
 
 
/*
C++ Mat ->numpy
*/
py::array_t cv_mat_uint8_1c_to_numpy(cv::Mat& input) {
 
    py::array_t dst = py::array_t({ input.rows,input.cols }, input.data);
    return dst;
}
 
py::array_t cv_mat_uint8_3c_to_numpy(cv::Mat& input) {
 
    py::array_t dst = py::array_t({ input.rows,input.cols,3}, input.data);
    return dst;
}

//注意,在c++中应包含 #include

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