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2020-06-06-T检验-计算TMB两种方式差异

TMB去除同意突变与非同义突变的差异

取样一组样本去重并且去除不合格样本后剩余427例样本
其中同意第一种使用非同义突变计算
数据取一个header，看看先

image.png

第二种使用同意突变计算，计算的相关性很好

image.png

做一个T检验

先看看是不是正态-目前看还算正态

image.png

TMB的结果高于cutoff与低于cutoff

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结果Pvalue=1表示两个样本的均值相同
证明去除同义突变对结果是无影响的

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