两种方式，一种是修改/system/framework/framework-res.apk中资源文件，另一种是自定义bootanimation.zip文件，前提都是手机已经获取root权限。测试时使用的是rk3399 7.1.2的系统，不同版本可能方法会有不同，但原理都一样。
方法一：
此方法的原理是android系统开机启动动画会先读取/system/media/目录下的bootanimation.zip文件，这个文件不存在的话，就会使用system/framework/framework-res.apk中assets目录下的两张图片做动画，/assets/images/android-logo-shine.png和/assets/images/android-logo-mask.png，所以，我们要做的就是替换这两张图片，实现想要的动画效果。这种方式的实现效果很有限，而且比较繁琐，所以还是更多推荐使用方法二。
第一步，下载安装apktool工具包。下面网站给出了详细的步骤Apktool - How to Install，选取自己对应的操作系统下载安装就行。其中chmod +x命令是给文件可执行权限，下面是mac上的命令行使用：
$ chmod +x apktool
执行命令后，apktool文件会显示为可执行文件。命令行中输入apktool 命令验证是否配置成功。
第二步，从手机/system/framework/目录下copy出framework-res.apk文件，需要做好备份，防止因修改错误导致手机系统损坏。
第三步，反编译framework-res.apk，运行下面命令反编译
$ apktool d framework-res.apk
d后面输入的是apk的绝对路径。运行结束后会在当前目录成framework-res.文件夹，结构如下：
然后就可以替换framework-res/assets/images目录下的两张图片了，替换完成后，重新打包apk：
$ apktool b framework-res
b后面参数是framework-res文件夹的绝对路径，运行成功后，会在framework-res/dist目录下生成新的framework-res.apk文件，解压该apk文件，拿到其中resources.arsc文件，和两张替换的动画图片。
第四步，需要下载一个可以查看、编辑压缩包，但不解压的工具。mac版的工具可以用BetterZip，windows版本的可以自行下载合适的工具。用该工具打开从系统中拿出来的framework-res.apk文件，用第三步中拿到的resources.arsc文件和两张图片文件替换framework-res.apk中对应的文件，最后将修改好的framework-res.apk文件放回手机/system/framework/目录下(默认情况下手机/system权限是只读的，需要在手机上安装Root Explorer，将/system目录权限改为可读写)，此时重启系统应该就可以看到修改完的开机动画了。
方法二：
前面已经提到，android系统会读取bootanimation.zip来执行开机动画，那么构建bootanimation.zip并替换就可以定制开机动画了。在定制之前需要先知道bootanimation.zip是怎么确定动画的。从/system/media/目录中copy出bootanimation.zip文件(有的系统中没有该文件也没关系，我们定制好直接放到该目录下动画一样会生效)，解压后如图：
part0到part3中都是存放的动画帧图片，desc.txt文件则是记录了播放逻辑，如下：
第一行： 920 330 表示图片的分辨率，这个可以根据系统屏幕分辨率和想要的动画效果自己定义，后面 60 表示帧率，即每s播放几帧图片。
第二行： c 为标识符，早期版本值都是p，即part的意思，代表这一行为一个动画片段。现在新增了c 标识符(具体什么版本加入未做深究)，表示该动画片段至少会执行一次，意思就是，如果系统发出终止动画指令，p标识的part会立刻停止执行，而c标识的part会继续播放完所有帧后停止，之后的part也是一样，如果标识为p，则不执行，为c，则执行一次，直到所有part都执行完。后面的 1 表示当前part循环次数，如果为0表示无限循环。 再后面的 0 表示延时n帧的时间后播放下一个part，比如当前例子里，帧率是60，那一帧时长为1/60s，所以延时n帧的时间就是n*(1/60)s。后面的 part0 是指图片文件夹的名字。
第三、四、五行同上，每一行均表示一个part。结合上面的例子来说，自上而下，将part分别定义为p1,p2,p3,p4,该动画的执行方式如下：p1执行一次-->p2执行并循环，如果此时收到系统终止动画指令，则p2-->执行完当次-->p3执行一次-->p4执行一次-->完成。
到这里，我们应该可以准备好图片文件和desc.txt文件了，下面要生成bootanimation.zip文件。这里要注意一下，在windows上压缩时需要选择存储模式压缩，在mac下，我没有找到这个选项，所以使用了命令行进行压缩，如下：
$ zip -r -0 bootanimation.zip *
将图片文件和desc.txt文件单独放到同一个文件夹下，在该文件夹下运行上面命令，会在当前文件生成bootanimation.zip文件。替换/system/media/中bootanimation.zip，然后重启就可以看到动画了，也可以通过命令行方式预览动画：
$ adb shell
$ cd /system/bin
$ bootanimation
最后，关于以上的动画执行逻辑，可以参阅源码，下面网址可以在线查阅源码AndroidXRef，主要的执行逻辑在/frameworks/base/cmds/bootanimation/BootAnimation.cpp文件中。