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某基因在正常人组织和肿瘤组织中的差异性表达

讲解流程

新建一个文件夹，准备输入文件和脚本，脚本分析，脚本运行，得到输出文件，如图所示。

具体操作之脚本分析

如图所示：我们需要设定基因表达量的最大值和最小值。因为基因表达量太高，图形很难看，具体详见输出文件分析。

具体操作之脚本运行

如图所示：先复制黏贴第一句话到R，按回车键运行，全选复制黏贴（ctrl a,ctrl c）到R，按回车键运行。

具体操作之输出文件分析

如图所示：我们可以看到：一个差异分析图，横坐标表示正常样品和肿瘤样品，纵坐标表示某个基因的表达量。当正常组织和肿瘤样品之间的p值小于0.05时，表示我们的基因在正常样品和肿瘤样品中的表达是存在差异的，而且这种差异是具有统计学意义。怎么看基因是否高表达？比如在正常样品中，看中间这根横线，这代表了基因表达的中位值，该基因在肿瘤样品中表达的中位值大于在正常样品中的中位值，则说明，该基因在肿瘤样品中高表达。

DOCTOR'S DAY

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