快速绘制分组小提琴图工具

“小提琴图 (Violin Plot) 用于显示数据分布及其概率密度”

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研究背景

这种图表结合了箱形图和密度图的特征，主要用来显示数据的分布形状。中间的黑色粗条表示四分位数范围，从其延伸的幼细黑线代表 95% 置信区间，而白点则为中位数，如下图所示。

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小提琴图不仅结合了箱线图和核密度图的功能，而且在文献中出现频率较高，如：2016中发表在Nature Medicine上的关于白血病中遗传异质性的文章中用小提琴图展示启动子epiallele对基因转录表达水平的影响[1]。所以下面跟着小编一起，不需要编程，点击数据，就可以完成小提琴图的绘制。

快跟着小编一起学习一下这个工具

网址导航

http://sangerbox.com/Tool 点击“快速绘制分组小提琴图工具”

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使用方法

1.1 示例数据说明

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第一列为样本的分组信息，分为两个类Cluster1与Cluster2，第二列到第七列为某种癌症六种免疫细胞的免疫评分，如下图所示：

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1.2 设置参数

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1.3 运行出图

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图片中一颗*表示统计检验的p<0.05，两颗**表示统计检验的p<0.01，三颗*表示统计检验的p<0.0001，-表示统计检验的p>0.05。

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1.4 特别注意

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这里回顾上一步骤--图片中一颗*表示统计检验的p<0.05，两颗**表示统计检验的p<0.01，三颗*表示统计检验的p<0.0001，-表示统计检验的p>0.05。

1.如果是以文件的格式将数据导入到云平台，平台默认无法读取Excel中的数据，必须将Excel文件转为以制表位符分割的文本文件，否则小工具将无法运行。

2.“快速绘制分组小提琴图工具”输入文件的第一列为分组信息，而且仅支持将输入数据分为两组的情况。

3.小工具针对组与组之间的检验，默认提供两种检验方法，即t检验和Wilcoxon用来检验两组数据是否具有差异性。

参考文献

[1] Li S, Garrett-Bakelman FE, Chung SS, et al. Distinct evolution and dynamics of epigenetic and genetic heterogeneity in acute myeloid leukemia. Nat Med. 2016;22(7):792‐799. doi:10.1038/nm.4125