精选|2018年9月R新包推荐

作者：Joseph Rickert

翻译：黄小伟，先后从事游戏、社交及金融数据研究及应用，目前就职杭州有赞

9月份，共有126个R新包收录于CRAN（8月份收录R新包160个），增幅连续下降，当然，这是R包经历过数量上快速增长后的正常变化。本期选摘了其中40个R新包，针对其主要功能做简单介绍，便于大家学习。包含八个类别：数据、金融、机器学习、科学、统计学、时间序列、工具和可视化，其中工具类R包将做重点介绍.

一. 数据

1. trigpoints : 提供British National Grid（OSGB36）坐标参考系统中历史GB标志点（帮助地图制作者和徒步旅行者的固定测量点）的完整数据集.

2. UKgrid : 提供自2011年以来英国国家电网需求数据（高压电力传输网络）.

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二. 金融

1. jubilee : 实现了Jubilee-Tectonic长期预测模型，用于预测美国股市的未来回报、国债收益率和黄金价格. ---量化同学可重点关注

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2. portsort : 支持通过条件或无条件排序，将资产分类为最多三个因子的投资组合.

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三. 机器学习

1. crfsuite : 针对CRFsuite进行封装，允许用户拟合条件随机场模型。重点是自然语言处理、有命名实体识别、文本分块、词性标注、意图识别和分类模型.

2. ELMSO : 实现Paulson, Luo和James(2018) 中描述的算法，该算法在一组在线广告机会中进行预算分配的实现.

3. embed : 提供使用简单的广义线性模型、非线性模型将因子预测变量转换为一个或多个数值表示的函数.

4. newsmap : 实施地理文件分类的半监督模型，同时包含英语、德语、西班牙语、日语和俄语的种子词典.

5. splinetree : 提供使用样条投影方法构建回归树、随机森林的功能.

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6. stylest : 提供评价演讲者（作者）风格的独特性的功能.

四. 科学

1. conStruct : 提供一种将遗传数据映射为离散层组合的方法，在每个离散层内，相关性可能随地理距离不断衰减.

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2. episcan : 提供一些有效的机制来扫描全基因组相互作用研究（GWIS）中的上位性，并支持病例对照状态（二元结果）和定量表型（连续结果）研究.

五.统计

1. ahpsurvey : 实现层次分析过程，一个由Saaty（1987）引入的通用多准则决策工具，它允许决策者权衡属性并评估呈现给属性的备选方案.

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2. empirical : 实现经验单变量概率密度函数（连续函数）和经验累积分布函数（阶梯函数或连续函数）.

3. basisMCMCplots : 提供用于检查来自NIMBLE软件包接口的单链、多链后验MCMC样本的功能.

4. MetaStan : 提供使用Stan进行贝叶斯元分析的函数，包括二项式 - 正态分层模型、使用弱信息先验的异质性参数、治疗效果参数等选项.

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5. Opt4PL : 提供获取和评估3、4和5种参数逻辑回归模型的各种最佳设计的功能.

6. rmatalog : 实现了metalog分布，这是一种现代的、高度灵活的、数据驱动的分布.

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7. rwavelet : 提供执行小波分析（正交和平移不变变换）的功能，同时进行数据压缩、去噪声.

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8. samplingBigData : 提供对大数据集进行采样的方法，包括在多维空间中进行空间平衡采样.

9. survivalAnalysis : 实现高级接口封装以支持生存分析，包括Kaplan-Meier分析、对数秩检验、Cox回归.

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10. ungroup : 提供实现惩罚复合链路模型的功能，有效地估计粗略分箱数据的平滑分布.

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六. 时间序列

1. bayesdfa : 使用Stan实现贝叶斯动态因子分析，这是一种多变量时间序列的降维工具.

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2. tbrf : 提供基于日期和时间窗口的滚动统计函数，而不是n-滞后观察.

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七. 工具

1. atable : 提供创建临床试验报告、描述性统计和假设测试的功能，同时支持使用LaTeX或Word将结果排列在表中.

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2. av : 实现与FFmpeg AV库的绑定，以便在R中处理音频和视频.

3. binb : 为RMarkdown中基于PDF的演示幻灯片提供一系列LaTeX样式.

4. broom.mixed : 将通过R中各种混合模型包拟合的对象转换为整洁的数据框格式.

5. codified : 允许作者使用元数据增加临床数据，以创建传统出版物、报告中使用的输出.

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6. duawrangler : 允许对受保护元素的原始数据文件创建可共享数据集的功能.

7. ipc : 提供用于在R进程之间传递消息的工具，其中Shiny示例显示了如何执行有用的任务.

8. piggyback : 针对git的50MB提交限制，允许更大（最多2 GB）的数据文件附加到各个GitHub版本的存储库中.

9. pysd2r : 使用reticulate包实现pysd的交互接口，提供大量的pysd函数，并且支持以Vensim、mdl或xmile格式读取文件.

10. radix : 提供基于Radix阅读器友好排版，可视化的灵活布局选项以及对脚注和引文的完全支持来格式化Web的科学和技术文章的功能.

11. rbtc : 实现比特币的RPC-JSON API，并为区块链的地址创建和内容分析提供实用程序功能.

12. salty : 允许用户获取真实或模拟数据，并将其与常见的错误相结合，例如伪OCR错误、Unicode问题、带有荒谬标点符号的数字字段、错误日期等.

八. 可视化

1. customLayout : 提供了graphics::layout()的扩展版本，允许用户通过组合更简单的布局为多个元素创建复杂的绘图区域.

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2. echarts4r : 允许用户通过利用Echarts 、JavaScript库创建交互式图表，它包括33种图表类型、动画等内容.

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3. ggparliament : 支持对议会的可视化，将选举结果可视化为建筑布局中的点.

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4. ggTimeSeries : 提供其他时间序列可视化，如日历热图、Steam Graph流图等.

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说明：限于个人水平，错误之处难免，烦请批评指正，共同交流~