R语言作图——3D scatter(3D散点图)

公众号：生信了
快来关注，一起学习吧

原创：黄小仙
它来了它来了，它顺着网线走来了...
哈哈，今天小仙给大家带来的是3D散点图。

强调一下啊，咱们这个教程里第一次出现了3D图，第一次出现了交互式图形（简单粗暴的理解， 用鼠标点击会动的图）

今天主要给大家介绍一下plotly这个R包，顺便分享下3D散点图的画法。
plotly是一个在线的数据分析和可视化工具，图表类型丰富、可交互等等一堆优点，关键是它还有相应的R包和Python包。R包的绘图风格是这个样子的，是不是还挺好看

如果大家想画交互式图形，可以试试这个包。
不过目前小仙对这个包的语句还不太熟悉，只能画个3D散点图简单示范一下啦

Step1. 绘图数据的准备
首先还是要把你想要绘图的数据调整成R语言可以识别的格式excel中保存成csv格式。
数据的格式如下图：

Step2. 绘图数据的读取

data<-read.csv(“your file path”, header = T) 

Step3.绘图所需package的调用

library(plotly)
 x <- data[, 1]
 y <- data[, 2]
 z <- data[, 3]

Step4.绘图

p <- plot_ly(data, x = ~x, y = ~y, z = ~z, color = ~data$Species,
               colors = c("#FF6DAE","#D4CA3A","#00BDFF"),
               marker = list(size = 5)) %>%
    add_markers()
p

调整3D点的大小

调整透明度

注意事项