没有猫但是有猫饼
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ImageJ——共标细胞计数

参考这篇 基本操作都差不多~
工具：Fiji（包含更多插件的ImageJ） 个人感觉比普通的ImageJ好用
思路：统计几张图片中相同的ROI 即为共标细胞
但是可能会与手数有一些偏差 我只是想定性 如果想要非常准确的结果可能不可以这样

1. 打开Fiji

打开Fiji

2. 找到想要统计的图片，拖到Fiji中

3. image- type- 8 bit 将图片转为黑白

image

4. 使用image-aadjust- threshold 调整对比度 尽量减少假阳性

5. 如果细胞有重叠，需要打散 使用 process-binary-watershed

这个时候细胞已经被打散，可以先计数一下

6. 使用 analyze - analyze particles - ok


按图中勾选 size那里可以规定最小的细胞

7. 结果会显示在results里面

results

这个表示有202个细胞

8. 将第一幅图的细胞添加至ROI中

8.1 edit - selection - creat selection

现在细胞会被黄色选中

8.2 ROI manager - add 将通道添加进来

9. 另外几个通道的图片同上，添加进ROI manager中

image.png

10. 按ctrl键盘选中两个区域 - more - and 提取共同的ROI

11. 这时交集会显示在图里 - 把共标图片add进ROI manager中

12. edit - selection - creat mask 构建共标的图片

13. 使用 analyze - analyze particles - ok 计数共标细胞个数

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