实时荧光 PCR 仪

在实时 PCR 热循环过程中,本文采用 CCD 相机获取随时间变化的荧光图像,该荧光图像从 20uL 毛细管中的 PCR 混合物中获取。

该荧光检测系统由一个作为激发光源的发光二极管 ( LED, 470nm ),CCD 相机和一个带有六个光学滤光片的转盘组成,可在 530、560、610、640、670 和 710nm 处提供六个荧光检测通道用于多重实时 PCR DNA 定量。

本文采用包含 HBV SC 11 DNA 模板和 SYBR Green I 荧光标记染料的 PCR 混合物来验证仪器的性能。

目前,同时检测多个目标 DNA 序列已成为病毒或血液诊断的趋势。对一种血液样本中不同病毒的检测称为多重实时 PCR。

本文建立基于比尔-朗伯定律 (Beer-Lambert law) 的分析模型来预测随着 PCR 热循环过程中 DNA 浓度的增加而增加的荧光强度。

预测值可用作确定 PCR 混合物中 DNA 的初始拷贝数。可与通过信号滤波算法在 CCD 相机捕获的荧光图像上获得的结果做对比。

因 CCD 相机的噪声较大,所以本文采用自适应滤波器( LUM 算法 ) 来消除荧光图像中的光学噪声。

图 1

图 1 所示为热循环仪的详细介绍。该系统需在 95℃ 下孵育 10 min。

之后,每次热循环经历 3s 95℃ 变性,10s 53℃ 退火, 16s 72℃ 延伸 来扩增 DNA 片段。

图 2 所示,为仪器的荧光采集系统。详细信息可见论文。

图 2


参考文献

[1] Developmentof a CCD-based fluorimeter for real-time PCR machine.

--尧灵

--2021.05.24

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