Pajek的数据格式转化和主要操作汇总

一、文献题录数据格式转换

来自数据库的数据文献转换。使用VOSviewer可以读取大部分的数据库的题录文献。
VOSviewer支持数据格式如下：

数据格式

在选择自己所需的节点，生成可视化图谱后，点击file面板>save>pajek即可保存net\pattition\vector文件。

保存界面

二、矩阵数据转换

部分研究由于是多个数据库数据合并或采用了网络数据，因此使用编程语言或矩阵构建工具(如bicomb)构建了共现矩阵，该转化可以通过通过文章《excel矩阵如何转化为pajek的net文件》构建net标准文件。
1.准备一个矩阵，这个矩阵可以是多值矩阵也可以是二值矩阵。
2.删除原始矩阵的行标签和列表签，添加定点标签和矩阵标签（注意：此时execl中不能有空格）

矩阵

3、execl文件保存成txt格式的文件，并使用ASCII编码。

保存

4、把上一步骤保存的txt文件的后缀名改为net，并双击打开。在Pajek中保存为标准文件。

更改

打开

标准保存

5、打开标准的net文件进行查看。把这个标准net文件的后缀改为csv风格，在excel表中实现替换。

查看

替换

替换后

生成的文件可以转化为map和network文件导入VOSviewer进行分析，也可以在Pajek中显示节点label。

pajek的主要操作快捷汇总

集聚系数： Pajek4.03版本（http://mrvar.fdv.uni-lj.si/pajek/） Network>Create Vector>Clustering Coefficient>CC1 Watts-Strogatz Clustering Coefficient （感觉像是基于小世界网络算出来的系数） Network Clustering Coefficient (Transitivity)

直径、两点之间最短距离、测地线（捷径）： Pajek4.03版本（http://mrvar.fdv.uni-lj.si/pajek/） Network>Create New Network>SubNetwork with paths> 分别是两点之间最短距离 多有点对之间最短距离 限定步长的两点之间最短距离 测地线 网络的直径

参考资料：
《excel矩阵如何转化为pajek的net文件》
Pajek计算常用值（直径、平均路径、集聚系数