周运来就是我
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单细胞数据挖掘||Pathway and Network Analysis of Gene List

本课件介绍了基于基因集的代谢通路以及网络分析，尽管这方面的研究最早不是应用在单细胞层面的，但是在单细胞数据挖掘过程中也可以给我们不少的启发。没有任何一个基因是孤岛。

在单细胞转录组 数据分析过程中我们我们是通过基因的表达和结构来描述细胞（群）的状态的，那么哪些基因是主要的，他们又是如何表现的，其实不是单因素能够说明的，所以之前开发的基于数据库的kegg/go等通路富集分析以及基于此的网络分析就派上用场了。

  • 如何选择一个基因集？
  • 关注哪些生物学过程？
  • network的结构如何呈现基因/细胞/通路关系？
  • pathway与network的区别与联系
  • 主要的还是基因集与数据库的选择
  • 基因集在单细胞(群)的表现可以定义单个细胞（群）的状态与类型
  • 介绍了几种pathway和network的工具
































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CellNetAnalyzer

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