python中读取带有cell元胞的.mat文件遇到：＜HDF5 object reference＞

问题：

在python中读取带有cell元胞的.mat文件，特别是对 7.3 版及可能更高版本的 mat 文件，使用h5py读取遇到的问题。解决总结：请安装使用hdf5storage包（对于更低版本的 mat 文件，hdf5storage似乎也可以兼容，推荐为最佳的mat到python转换手段）

对于 7.3 版及可能更高版本的 mat 文件，我在 Matlab 中将元胞数组保存为 .mat 文件，如下所示：

test = {'hello'; 'world!'};
save('data.mat', 'test', '-v7.3')

如何使用 H5py 将其作为 Python 中的字符串列表导入？

我试过

f = h5py.File('data.mat', 'r')
print f.get('test')
print f.get('test')[0]

这打印出：

[ ]

['hello', 'world!']如何取消引用

 ]

获取.mat 中的元胞内容？

解决：

To load a MATLAB cell array from a .mat file using the hdf5storage library in Python, you can follow：

要使用hdf5storage库在Python中加载包含MATLAB元胞数组的.mat文件，您可以按照以下步骤进行操作：

1. 安装hdf5storage库：确保您已经在Python环境中安装了hdf5storage库。您可以使用以下命令通过pip安装它：https://github.com/frejanordsiek/hdf5storage

pip install hdf5storage

1. 加载.mat文件并获取元胞数组：以下是使用hdf5storage库加载.mat文件并获取元胞数组的示例代码段：

import hdf5storage

# 加载.mat文件
mat_data = hdf5storage.loadmat('your_file.mat')

# 访问元胞数组
cell_array = mat_data['name_x']

# 遍历元胞数组的元素
for item in cell_array:
    # 打印每个元胞的内容
    print(item)

1. 请确保将'your_file.mat'替换为实际的.mat文件路径。

   通过使用hdf5storage库，您可以直接从.mat文件中加载MATLAB元胞数组，无需事先将其转换为HDF5格式。这样不会出现

 ]

总结：——python读取mat的各种方法及优缺点：

sio不能读7.3和以上版本的mat，h5py读不了多重元胞，这个hdf5storage都可以搞。

 

h5py: 用于读取的Matlab -v7.3形式保存的变量。缺点：无法读取过于复杂的元胞变量结构。

import h5py

fHC = h5py.File('H:/616.mat', 'r')
tdata = fHC['name_x'] [:] # name_x 是变量名
data = np.array(tdata).T  # For converting to a NumPy array

scipy.io: 用于读取的Matlab默认的 -v7形式保存的变量。缺点：无法读取-v7.3形式保存的变量。

import scipy.io as sio

file_path = "bc_1.mat"
data_dict = sio.loadmat(file_path)
data_list = data_dict['name_x'].tolist()

hdf5storage: 可以用于读取的Matlab -v7.3和-v7 形式保存的变量。缺点：待发现。

import hdf5storage
# 加载.mat文件
mat_data = hdf5storage.loadmat('your_file.mat')
# 访问元胞数组
cell_array = mat_data['name_x']
# 遍历元胞数组的元素
for item in cell_array:
    # 打印每个元胞的内容
    print(item)