在线作图|如何绘制一张气泡图

Question 1:什么是气泡图

气泡图(bubble chart)形似气泡,是用于展示三个变量之间关系的数据统计分析图表之一,它最多能够实现同一个事物的四个维度的直观的数据可视化。气泡图横纵坐标各是一个变量,第三个变量用气泡的大小来表示,与此同时还可以加入一个表示大小的变量进行比对。在生信分析中,GO/KEGG功能注释和富集分析气泡图是比较常见的。

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Question 2:如何不使用R绘制气泡图?

云图图(https://www.cloudtutu.com/#/index),操作步骤如下:
①登录网址:https://www.cloudtutu.com/#/index(推荐使用360或者谷歌浏览器)
②输入用户名和密码(已经为大家填好了),输入验证码后即可登录,无需注册,直接使用,不必担心隐私泄露,是不是诚意满满~
③登录后在工具一栏(全部分析)里找到气泡图,点击进入;
④请按照界面右侧的说明书或者下文进行操作,即可在2分钟内获得气泡图。
话不多说,我们开始行动吧~

Step 1:上传文件
※目前平台仅支持.txt(制表符分隔)文本文件或者.csv文件的文件上传。(平台可对不规范的数据格式进行部分处理,但还是请您尽量按照示例数据的格式调整数据,以便机器可以识别)
a)准备一个数据矩阵(形式参照示例数据,如微生物物种丰度表、基因表达量矩阵、代谢物含量表,也可以是测量数据,例如身高、体重、表型等);
b)表格需要带表头和列名,每一列为样本名,每一行为各种指标数据名,例如OTU,基因ID、身高、代谢物名称等。
c)请提交txt(制表符分隔)文本文件或者.csv文件。操作方法为:全选excel中的所有内容(ctrl+A),复制到记事本中,将记事本文件另存后点击“上传”按钮上传该文件。

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Step 2:参数设置
2.1 自定义横坐标:按照需求自行设置
2.2 自定义纵坐标:按照需求自行设置
2.3 绘制数量:绘制前多少个元素,剩余元素会合并成others展示
2.4 颜色选择:颜色1:高值颜色,颜色2:低值颜色
2.5 横坐标字体旋转:为图片美观旋转横坐标字体角度

Step 3:下载文件
点击“运行”开始作图,点击“下载”保存PDF格式的矢量图。PDF格式的文件可通过矢量图编辑工具进行编辑。

Step 4:作图后处理
TUTU云平台提供的是PDF格式的矢量图,可通过矢量图处理软件进行编辑和调整(如:文字字体,文字大小,图片分辨率等)。

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