最新版SRA 数据库上传操作说明

作者：童蒙
编辑：amethyst
审稿：Arno

最近NCBI在SRA数据上传方面改版了操作过程，较之前的操作而言，方便了很多，也明确了很多。上传SRA是一个很常见的活，总结来说可以分为三步：

• 1、注册与登陆
• 2、填信息（填写BioProject、BioSample、Run）
• 3、上传数据

1.创建帐号

在上传数据之前，需要先注册一个 NCBI 账号，登陆 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/account/，点击如下图所示的“Register for a NCBI account”，进入到注册页面。如果已经注册了 NCBI 账号，就可以直接跳入下一环节！

2.填信息

1.找到页面

• 从首页（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/）进入，点击Submit
  

• quick start 选择SRA

  
  

• 点击 New submission

  
  

2.填信息

• 填个人信息

  
  

• 填general info，如实填写就好。

  
  
  
  

  如果您是第一次上传，这里选择“No”选项。
  如果是补充之前项目的数据，选择“Yes”同时，填写BioProject ID。

  
  
  
  在这里可以选择发布时间，请根据实际情况选择。
  

• 填写project Info，包括项目的标题，项目摘要，以及研究课题所属的方向（可选填）。

  
  

• 选择样品类型信息，根据实际情况选择就好了，需要注意有的类型有展开的二级类型，需要选择。

  
  

• 填写样品信息。这里是经常出错的地方，大家要注意。

  
  

• 注意事项

01.样品少可以用网页页面直接填写，样品多可以上传excel文件
02.下载excel表格，填写后，上传
03.填的时候要注意，绿色必填，蓝色至少填一个，黄色选填，并且每两行不能一模一样，得有差异
04.填完后，添加附件，上传

• 填写实验相关信息，也有两种方式，直接网页填写和填写文件后上传。

  
  
  
  

  这种信息一般如实填写就好了，如果有不懂的可以联系测序公司。

3. 传文件

• 上传数据

  
  
  
  

  可以用网页、FTP/Aspera 或者亚马逊传输，可以根据实际情况选择。
  如果样品少，可以用网页；如果样品多，可以用FTP或者Aspera，说明都很详细，一步一步来就行。

  
  
• 上传完成后，就是最后一步Review and submit。
  这次NCBI的改版相对之前的操作而言，方便了很多，也明确了很多。相对于之前先建立biosample，bioproject，再建立run，从使用上方便了很多，希望大家都能很顺利的上传自己的数据。