？ModuleNotFoundError: No module named 'scanpy'

ModuleNotFoundError：No module named xxx 罪魁祸首竟是虚拟环境_qunqunsung的博客-CSDN博客

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在ide中执行python程序，都已经在默认的项目路径中，所以直接执行是没有问题的。但是在cmd中执行程序，所在路径是python的搜索路径，如果涉及到import引用就会报类似ImportError: No module named xxx这样的错误，解决方法：

在报错的模块中添加：

import sys
import os
curPath = os.path.abspath(os.path.dirname(file))
rootPath = os.path.split(curPath)[0]
sys.path.append(rootPath)

这样就可以解决了

另外在cmd中执行python程序时注意python版本，如果装了两个版本的话，切换版本：

在环境变量中path中修改python版本

-----------------再次补充

先看报错是哪个模块，然后将换个模块的路径添加到sys，注意例如我有这样一个路径报错

/usr/local/bin/python3.6 /Users/louchengwang/PycharmProjects/Sanjieke/src/utils/config.py

报错是

No module named 'src'

那么首先确定去执行的文件中config.py添加src模块的路径

然后rootpath要确定最终应该append的应该是/Users/louchengwang/PycharmProjects/Sanjieke，而不是到src,这里要注意应该是

curPath = os.path.abspath(os.path.dirname(file))
rootPath = os.path.split(curPath)[0]
sys.path.append(os.path.split(rootPath)[0])

一定要注意自己的目录结构，如果不成功就打印append的path，确定好
python程序在命令行执行提示ModuleNotFoundError: No module named 'XXX' 解决方法 - 不当咸鱼 - 博客园 (cnblogs.com)
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