聚类(cluster)与分类(class)问题不同,聚类是属于无监督学习模型,而分类属于有监督学习。聚类使用一些算法把样本分为N个群落,群落内部相似度较高,群落之间相似度较低。在机器学习中,通常采用“距离”来度量样本间的相似度,距离越小,相似度越高;距离越大,相似度越低.
相似度使用欧氏距离来进行度量. 坐标轴上两点 x 1 , x 2 x_1, x_2 x1,x2之间的欧式距离可以表示为:
∣ x 1 − x 2 ∣ = ( x 1 − x 2 ) 2 |x_1-x_2| = \sqrt{(x_1-x_2)^2} ∣x1−x2∣=(x1−x2)2
平面坐标中两点 ( x 1 , y 1 ) , ( x 2 , y 2 ) (x_1, y_1), (x_2, y_2) (x1,y1),(x2,y2)欧式距离可表示为:
∣ ( x 1 , y 1 ) − ( x 2 , y 2 ) ∣ = ( x 1 − x 2 ) 2 + ( y 1 − y 2 ) 2 |(x_1,y_1)-(x_2, y_2)| = \sqrt{(x_1-x_2)^2+(y_1-y_2)^2} ∣(x1,y1)−(x2,y2)∣=(x1−x2)2+(y1−y2)2
三维坐标系中 ( x 1 , y 1 , z 1 ) , ( x 2 , y 2 , z 2 ) (x_1, y_1, z_1), (x_2, y_2, z_2) (x1,y1,z1),(x2,y2,z2)欧式距离可表示为:
∣ ( x 1 , y 1 , z 1 ) , ( x 2 , y 2 , z 2 ) ∣ = ( x 1 − x 2 ) 2 + ( y 1 − y 2 ) 2 + ( z 1 − z 2 ) 2 |(x_1, y_1, z_1),(x_2, y_2, z_2)| = \sqrt{(x_1-x_2)^2+(y_1-y_2)^2+(z_1-z_2)^2} ∣(x1,y1,z1),(x2,y2,z2)∣=(x1−x2)2+(y1−y2)2+(z1−z2)2
以此类推,可以推广到N维空间.
∣ ( x 1 , y 1 , z 1 . . . , n 1 ) , ( x 2 , y 2 , z 2 , . . . n 2 ) ∣ = ( x 1 − x 2 ) 2 + ( y 1 − y 2 ) 2 + ( z 1 − z 2 ) 2 + . . . ( n 1 − n 2 ) 2 |(x_1, y_1, z_1...,n_1),(x_2, y_2, z_2,...n_2)| = \sqrt{(x_1-x_2)^2+(y_1-y_2)^2+(z_1-z_2)^2+...(n_1-n_2)^2} ∣(x1,y1,z1...,n1),(x2,y2,z2,...n2)∣=(x1−x2)2+(y1−y2)2+(z1−z2)2+...(n1−n2)2
二维平面两点 a ( x 1 , y 1 ) a(x_1, y_1) a(x1,y1)与 b ( x 2 , y 2 ) b(x_2, y_2) b(x2,y2)两点间的曼哈顿距离为:
d ( a , b ) = ∣ x 1 − x 2 ∣ + ∣ y 1 − y 2 ∣ d(a, b) = |x_1 - x_2| + |y_1 - y_2| d(a,b)=∣x1−x2∣+∣y1−y2∣
推广到N维空间, x ( x 1 , x 2 , . . . , x n ) x(x_1, x_2, ..., x_n) x(x1,x2,...,xn)与 y ( y 1 , y 2 , . . . , y n ) y(y_1, y_2, ..., y_n) y(y1,y2,...,yn)之间的曼哈顿距离为:
d ( x , y ) = ∣ x 1 − y 1 ∣ + ∣ x 2 − y 2 ∣ + . . . + ∣ x n − y n ∣ = ∑ i = 1 n ∣ x i − y i ∣ d(x,y) = |x_1 - y_1| + |x_2 - y_2| + ... + |x_n - y_n| = \sum_{i=1}^n|x_i - y_i| d(x,y)=∣x1−y1∣+∣x2−y2∣+...+∣xn−yn∣=i=1∑n∣xi−yi∣
在上图中,绿色线条表示的为欧式距离,红色线条表示的为曼哈顿距离,黄色线条和蓝色线条表示的为曼哈顿距离的等价长度。
闵可夫斯基距离(Minkowski distance)又称闵氏距离,其定义为:
D ( x , y ) = ( ∑ i = 1 n ∣ x i − y i ∣ p ) 1 p D(x, y) = (\sum_{i=1}^n |x_i - y_i|^p)^{\frac{1}{p}} D(x,y)=(i=1∑n∣xi−yi∣p)p1
当 p = 1 p=1 p=1时,即为曼哈顿距离
当 p = 2 p=2 p=2时,即为欧式距离
当 p → ∞ p \rightarrow \infty p→∞时,即为切比雪夫距离
可见,曼哈顿距离、欧氏距离、切比雪夫距离都是闵可夫斯基的特殊形式.
如果 d i s t ( x , y ) dist(x,y) dist(x,y)度量标准为一个距离,它应该满足以下几个条件:
原型聚类也称“基于原型的聚类”(prototype-based clustering),此类算法假设聚类结构能通过一组原型刻画,在现实聚类任务中极为常用. 通常情况下,算法先对原型进行初始化,然后对原型进行迭代更新求解. 采用不同的原型表示、不同的求解方式,将产生不同的算法. 最著名的原型聚类算法有K-Means.
密度聚类也称“基于密度的聚类”(density-based clustering),此类算法假定聚类结构能通过样本分布的紧密程度确定. 通常情况下,密度聚类算法从样本密度的角度来考察样本之间的可连接性,并基于可连接样本不断扩展聚类簇以获得最终的聚类结果. 著名的密度聚类算法有DBSCAN.
层次聚类(hierarchical clustering)试图在不同层次对数据集进行划分,从而形成树形的聚类结构. 数据集的划分可以采用“自底向上”或“自顶向下”的策略. 常用的层次聚类有凝聚层次算法等.
K均值聚类(k-means clustering)算法是一种常用的、基于原型的聚类算法,简单、直观、高效。其步骤为:
第一步:根据事先已知的聚类数,随机选择若干样本作为聚类中心,计算每个样本与每个聚类中心的欧式距离,离哪个聚类中心近,就算哪个聚类中心的聚类,完成一次聚类划分.
第二步:计算每个聚类的几何中心,如果几何中心与聚类中心不重合,再以几何中心作为新的聚类中心,重新划分聚类. 重复以上过程,直到某一次聚类划分后,所得到的各个几何中心与其所依据的聚类中心重合或足够接近为止. 聚类过程如下图所示:
注意事项:
(1)聚类数(K)必须事先已知,来自业务逻辑的需求或性能指标.
(2)最终的聚类结果会因初始中心的选择不同而异,初始中心尽量选择离中心最远的样本.
聚类数(K)必须事先已知,借助某些评估指标(轮廓系数),优选最好的聚类数。
聚类中心的初始选择会影响到最终聚类划分的结果。初始中心尽量选择距离较远的样本。
import sklearn.cluster as sc
# n_clusters : 聚类数
model = sc.KMeans(n_clusters=4)
# 不断调整聚类中心,知道最终聚类中心稳定则聚类完成
model.fit(x)
# 获取训练结果的聚类中心
labels = model.labels_
centers = model.cluster_centers_
pred_y = model.predict(x)
import numpy as np
import pandas as pd
import sklearn.cluster as sc
# 加载数据
data = pd.read_csv('multiple3.txt', header=None)
data.plot.scatter(x=0, y=1, s=50)
model = sc.KMeans(n_clusters=4)
model.fit(data)
labels = model.labels_
ax = data.plot.scatter(x=0, y=1, c=labels, cmap='brg', s=50)
# 获取四个聚类中心
centers = model.cluster_centers_
centers = pd.DataFrame(centers)
centers.plot.scatter(x=0, y=1, c='red', marker='+', s=300, ax=ax)
(1)原理简单,实现方便,收敛速度快;
(2)聚类效果较优,模型的可解释性较强;
(1)需要事先知道聚类数量;
(2)聚类初始中心的选择对聚类结果有影响;
(3)采用的是迭代的方法,只能得到局部最优解;
(4)对于噪音和异常点比较敏感.
(1)事先知道聚类数量
(2)数据分布有明显的中心
import sklearn.metrics as sm
# v: 平均轮廓系数
# metric: 距离算法:使用欧几里得距离(euclidean)
v = sm.silhouette_score(输入集, 输出集, sample_size=样本数, metric=距离算法)
import sklearn.metrics as sm
model = sc.KMeans(n_clusters=4)
model.fit(data)
labels = model.labels_
# 计算轮廓系数
s = sm.silhouette_score(data, labels, sample_size=len(data), metric='euclidean')
print(s) # 0.5773232071896658
噪声密度(Density-Based Spatial Clustering of Applications with Noise, 简写DBSCAN)随机选择一个样本做圆心,以事先给定的半径做圆,凡被该圆圈中的样本都被划为与圆心样本同处一个聚类,再以这些被圈中的样本做圆心,以事先给定的半径继续做圆,不断加入新的样本,扩大聚类的规模,知道再无新的样本加入为止,即完成一个聚类的划分. 以同样的方法,在其余样本中继续划分新的聚类,直到样本空间被耗尽为止,即完成整个聚类划分过程. 示意图如下:
DBSCAN算法中,样本点被分为三类:
边界点(Border point):可以划分到某个聚类,但无法发展出新的样本;
噪声点(Noise):无法划分到某个聚类中的点;
核心点(Core point):除了孤立样本和外周样本以外的样本都是核心点;
上图中,A和B为核心点,C为边界点,D为噪声点. 此外,DBSCAN还有两个重要参数:
邻域半径:设置邻域半径大小;
最少样本数目:邻域内最小样本数量,某个样本邻域内的样本超过该数,才认为是核心点.
# DBSCAN 聚类器
# eps: 半径
# min_samples: 聚类样本数的下限,若低于该数值,则称为孤立样本
model = sc.DBSCAN(eps=epsilon, min_sample=5)
model.fit(x)
model.core_sample_indices_
(1)不用人为提前确定聚类类别数K;
(2)聚类速度快;
(3)能够有效处理噪声点(因为异常点不会被包含于任意一个簇,则认为是噪声);
(4)能够应对任意形状的空间聚类.
(1)当数据量过大时,要求较大的内存支持I/O消耗很大;
(2)当空间聚类的密度不均匀、聚类间距差别很大时、聚类效果有偏差;
(3)邻域半径和最少样本数量两个参数对聚类结果影响较大.
(1)数据稠密、没有明显中心;
(2)噪声数据较多;
(3)未知聚簇的数量.
import numpy as np
import pandas as pd
import sklearn.cluster as sc
# 加载数据
data = pd.read_csv('multiple3.txt', header=None)
data.plot.scatter(x=0, y=1, s=50)
# DBSCAN 算法实现聚类
# 创建DBSCAN模型并训练模型
params = np.arange(0.5, 1.0, 0.1)
models, scores, epss = [], [], []
for param in params:
model = sc.DBSCAN(eps=param, min_samples=5)
model.fit(data)
labels = model.labels_
# labels # -1很多,所以有很多孤立样本,半径太小
score = sm.silhouette_score(data, labels, sample_size=len(data), metric='euclidean')
models.append(model)
scores.append(score)
epss.append(param)
best_ind = np.argmax(scores)
best_model = models[best_ind]
best_score = scores[best_ind]
best_eps = epss[best_ind]
best_model, best_score, best_eps
"""
(DBSCAN(eps=0.7999999999999999), 0.41779833446624154, 0.7999999999999999)
"""
# 利用最优模型绘图
labels = best_model.labels_
data.plot.scatter(x=0, y=1, s=50, c=labels, cmap='brg')