生信学习小组-Day5 - 三三

关键词

R语言，数据类型，向量，数据框

今日笔记

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<一> 向量

来自生信星球

1. 赋值命令

• x<- num1:num2
• x<- seq(num1,num2,by=a)
• x<- rep(num1:num2,times=a)

应用举例

2. 从向量中提取元素

（1）根据元素位置

（2）根据值

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<二> 数据框

1. 读取本地数据

• read.csv()

read.csv()

• read.table()

read.table()

2. 设置行名和列名

• colnames() # 查看列名
• rownames() # 查看行名

3. 数据框的导出

• write.table(frame,file = "bjyx.txt",sep = ",",quote = F) #分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带有双引号）

4. 变量的保存与重新加载（格式为RData）

• save.image(file="bjyx.RData") # 保存当前所有变量
• save(frame1,file="frame1.RData") # 保存其中一个变量

保存文件名为"bjyx.RData"

• load("frame1.RData") # 加载命令

加载"bjyx.RData"

5. 提取元素

• x[a,b] # 提取第a行第b列
• x[a,] # 提取第a行
• x[,b] 与 x[b] # 提取第b列（两种命令格式有差异）
• x[a:b] # 第a列到第b列
• x[c(a,b)] # 第a列和第b列
• x$b # 提取b列

应用举例

6. 直接使用数据框中的变量

（1）提取某两列作散点图（不够高效

a <-data.frame(case=paste("S",c(1:50)),values=runif(50))
plot(a$case,a$values)

（1）

（2）attach

attach(a)
plot(case,values)

（2）

（3）with

with(a,{
plot(case,values)
x<<-summary(values)
})
x # 运行完后打印 x

（3）

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Tips

• ?+命令 可查看帮助
• 命令未输完（括号啥的没补全）时回车才可以换行...