Ubuntu/Windows Jupyter 安装IRkernel

我习惯用jupyter notebook 写代码，最近需要用到R语言，就想到能不能顺便把Anaconda配置一个R语言的虚拟环境，然后把内核连到jupyter notebook上。说干就干，下面把过程记一下，方便以后参考。

Windows 10

参考 https://zhuanlan.zhihu.com/p/117361746

1. 我装的是miniconda，Anaconda的精简版。

国内镜像可以从清华源(https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/, 配置详见 https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/help/anaconda/)，南大源(https://mirror.nju.edu.cn/anaconda/miniconda/, 配置详见 https://nju-mirror-help.njuer.org/anaconda.html）都查到。

2. jupyter 需要另外安装

打开Anaconda Prompt, 输入

conda isntall jupyter

3. R 因为anaconda的虚拟环境总是报错，我直接在Windows系统里面安装的，选的是3.6.3版本。直接百度官网下载即可。国内镜像也有（https://mirror.nju.edu.cn/CRAN/）。如果需要Rstudio, 也可以官网下载(https://rstudio.com/products/rstudio/download/)

4.下面是关键的步骤

（1）确认你的R语言安装路径，一般都是 C:\Program Files\R\R-3.5.2\bin
（2）记下来你的“R程序启动位置”之后，找“Anaconda Powershell Prompt(Miniconda)"，不要打开第二个Anaconda Prompt (Miniconda)

image.png

（3）在里面输入R所在的路径
注意：如果路径名称有空格，需要把整个路径加引号

image.png

（4）然后就是下一行，直接打一个“R”，意思就是打开此路径下的R程序
再下一行，复制这句话：

install.packages('IRkernel')

剩下如果跳出来需要你决定什么协议啥的，所有步骤都打y

（意思就是接受yes或者不接受no，你不打它就一直停着）

可能会弹出来一个选择下载地址的页面，你选一个离你近的就行
（5）最后，当这个Install结束，会停止然后出来一行表示已经完成的语句

最后我们在下一行打以下命令：

IRkernel::installspec()

等待安装，出现任何需要你选的东西都打y就行

再打开jupyter你就有了R的环境

image.png

Ubuntu 18.04

1. 创建并激活R4.0.3虚拟环境

conda create -n R4.0.3
conda activate R4.0.3

image.png

2.安装R4.0.3

直接conda install R 安装的是3.4.4，我想用比较新的4.0.3。特意去anaconda官网仓库查了，有这个软件包。https://anaconda.org/conda-forge/r-base
也可以用conda search r-base直接查可用版本
根据下面的命令，一条一条的试即可（我是第一条就成功了）

image.png

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3. 安装IRkernel

按照正常的指示，需要输入R，进入R语言界面
然后，输入下面两条命令

install.packages("IRkernel")
IRkernel::installspec()#针对当前用户
IRkernel::installspec(user=FALSE)#针对全系统

但是，这会报错
”jupyter-client has to be installed but “jupyter kernelspec --version” exited with code 127“

经过搜索尝试，解决方法如下：

install.packages('devtools')
devtools::install_github('IRkernel/IRkernel')
IRkernel::installspec()