biomod2介绍与正确安装

biomod2-package: Species Distribution Modeling within an Ensemble Forecasting

biomod2提供了运行多达10种物种分布模拟模型，以模拟特定物种与其环境之间的关系，试图利用环境变量（温度、降水......）来定义一个特定物种的生态位。例如，在气候和土地利用变化的情况下进行未来预测的潜在用途。尽管它主要是为旨在预测物种分布的生态学家开发的，但biomod2也可用于模拟任何二项式数据（例如，基因、标记、生态系统......）与任何解释变量的关系。

biomod2在CRAN库中位置：https://cran.r-project.org/web/packages/biomod2/index.html 

安装指南：biomod2 manual （CRAN链接中下载）

biomod2的最新版本发布在github中：https://github.com/biomodhub/biomod2 

（一）一般安装方法（不推荐）

1. 安装稳定版 stable version (from cran)

命令： install.packages("biomod2", dependencies = TRUE)

（二）正确安装姿势：

1. 安装biomod2需要从从devtools::install_github('biomodhub/biomod2')安装（最新版，安装时需要有devtools包，临时调用devtools包）

安装devel version (from biomodhub)

命令：devtools::install_github("biomodhub/biomod2", dependencies = TRUE)

2. 安装目录不能有空格！（以免后续出麻烦）

3. 确保Maxent软件能够正常使用！（需要设置Maxent的jar文件到系统环境变量PATH）