学习小组Day5笔记-zkh

R-数据结构

  • 表格在R语言中叫数据框
  • 函数或者命令不会用时,除了百度/谷歌搜索以外,用这个命令查看帮助:?read.table,调出对应的帮助文档,翻到example部分研究一下。

数据类型

向量

  • 元素:数字或者字符串(用chr表示)等
  • 标量:一个元素组成的变量
  • 向量:多个元素组成的变量


    1.png

    <- #赋值,下一次的赋值会覆盖上一次的赋值
    e.g.x<- 1:10 #从1-10之间所有的整数
    x<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数(注意是逗号不是分号)
    x<- rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次

从向量中提取元素

  • 根据元素位置
    e.g.
    x[4] #x第4个元素
    x[-4]#排除法,除了第4个元素之外剩余的元素
    x[2:4]#第2到4个元素
    x[-(2:4)]#除了第2-4个元素
    x[c(1,5)] #第1个和第5个元素
  • 根据值
    e.g.
    x[x==10]#等于10的元素
    x[x<0]
    x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c(1,2,5)中的元素

数据框

  • 将示例数据放在你的工作目录下(!!!重要)
  • x<-read.csv('doudou.txt') #获得数据框
    read.table(file="huahua",sep="\t",header=T) #读取本地数据
  • 设置行名和列名
    x<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
    colnames(x) #查看列名
    rownames(x) #查看行名,默认值的行名就是行号,1.2.3.4...
    colnames(x)[1]<-"bioplanet" #修改左上角第一格名称,如果要修改回来,用read.table命令重新赋值一遍就可以覆盖掉刚才修改的内容
    X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1) #最后row.names的意思是修改第一列为行名
  • 数据框的导出
    write.table(x,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F) #x是数据框被赋予的变量名,分隔符改为逗号,字符串不加双引号(默认格式带由双引号)
  • 变量的保存与重新加载
    这次没有处理完的数据下次可以接着用,保存的格式是RData。
    save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
    save(X,file="test.RData")#保存其中一个变量
    load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令
  • 提取元素
    X[x,y]#第x行第y列
    X[x,]#第x行
    X[,y]#第y列
    X[y] #也是第y列
    X[a:b]#第a列到第b列
    X[c(a,b)]#第a列和第b列
    X$列名#也可以提取列


    R-数据类型.png

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