如何绘制漂亮的Circos图

在生信分析中，如何在染色体层面查看不同区域/基因的表达情况，差异显著性呢？能否有一个图能够通过不同的图表样式，展示P值、上下调表达差异、均值等不同类别数据特征呢？为了解决这个问题，派森诺基因云特此推出了“染色体Circos图”，耗时半月倾心制作，此图不仅颜值顶顶而且可调参数众多，快来随小编一探究竟~

一、图层设置

1.1图表绘制模式

每一圈层可以绘制不同图表类型，也可以绘制相同图表类型。

默认绘制的四层图表分别是热图（常用于显示P值等数据），散点图（常用于显示上调倍数等数据），折线图（常用于显示上调倍数均值等数据），柱状图（常用于显示上调基因下调基因表达等数据），额外增加的两层分别是散点图和柱状图，每个圈层均可切换以上四种图表类型。

1.2热图图表调整

根据上传的数据，默认将第四列到最后一列所有value值当作热图数据作图，我们可以通过勾选列名来筛选实际热图数据作图，或选择热图数据中部分value值在图上显示。

1.3柱状图宽度调整

根据上传的数据，我们会计算出最优的柱形宽度，可通过宽度系数按比例缩小柱形宽度；另外，也可指定上传数据中某一列为每个柱形设置具体宽度。提交绘图之后，点击项目列表的图标即可查看。

二、背景着色方式

着色方式可分为：环形着色（单色着色模式），扇形着色（多色着色模式）。

三、图表间距设置

既可以调整轨道（环形）与轨道之间的间距，也可以调整染色体（扇形）与染色体之间的间距。

四、标签的显示

可以控制最外层标签以及刻度线是否显示，分别组合为以下4种模式。

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