利用TCGA数据库选题，毕业稳了

有很多医学研究生或者临床医生说不会选题，今天来分享一下如何利用TCGA数据库进行选题，参考文章：Elevated TEFM expression promotes growth and metastasis through activation of ROS/ERK signaling in hepatocellular carcinoma，这篇文章发表在Cell Death & Disease上，影响因子：6.3，中科院最新分区：二区，属于OA期刊，需要收取版面费，不在中科院发布的国际预警期刊名单上。

1、选题选题，也就是我们寻找一个没有人做过类似研究内容的基因。按照参考范文的思路，我们可以下载TCGA数据进行差异分析，生存分析，发现这个基因在肝癌中表达上调或者下调，并且对预后有影响的，然后查阅文献看看没有人做过，如果没有人做过的话就可以作为候选基因开展后续工作。

2、我们仅用TCGA数据分析不一定是可靠的，所以需要自己收集临床样本进行表达量的验证，组织的表达、细胞系的表达、蛋白表达水平这些验证都跟TCGA数据分析一致的话，就可以开展后面细胞功能实验。

3、探索这个基因对肝癌细胞的增殖、转移的影响。

3、做完了细胞功能实验，就要探索这个基因的上下游调控机制（受那一条miRNA调控、激活那一条信号通路发挥作用），当然，如果经费不足就没有办法开展下去。

总结：

除了使用TCGA数据库选题，我们也可以使用GEO数据库进行选题，特别是非肿瘤方向。我们根据数据挖掘的方法选出的候选基因不一定能够在实验中得到验证或者理想的预期结果，也有可能导致后续工作无法开展，从而发不了文章。因为科研都是存在一定风险的，而且风险的高低往往跟你文章的高度成正比。你的论证思路复杂，实验操作难度大，花的经费就多了，风险也高了，发文章的分数自然而然就高；你的论证思路简单，内容分析少，花的经费就少了，风险也低，文章的分数就高不了。