Ubuntu 下如何安装FSL

网上关于FSL安装的介绍很多，大部分都不完整，最近刚刚安装完一次，把步骤总结如下，供小伙伴参考。

1 还是要去官网下载安装文件 和测试文件

官网链接：https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/

安装文件：fslinstaller.py

测试文件：fsl-6.0.5-feeds.tar.gz

2 安装

安装FSL需要用Python2，因为Ubuntu默认的安装是Python3，因此需要安装Python2，安装方法如下：

sudo apt install python2.7 # 安装python2

gedit ~/.bashrc
alias python2=/usr/bin/python2.7 # 打开配准文件，并为python2.7设置匿名，以区别python3

cd ~/Downloads
python2 fslinstaller.py  # 转到下载目录进行安装，此过程需要下载大量文件，一般需要12个小时以上

3 如果有报错，提示安装有失败的内容，尝试下面操作：

sudo rm -r $FSLDIR/fslpython   # 删除此python配置路径
sudo $FSLDIR/etc/fslconf/fslpython_install.sh -f $FSLDIR  # 安装缺失文件

4 测试

tar zxvf fsl-*-feeds.tar # 解压缩feeds文件

usr/bin/time ./RUN all # 在feeds目录下运行此命令，进行测试

如果没有大于1%的报错，证明安装全面无误，可以放心使用了:)