长腿猴子请来的救兵
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利用GAT（图论分析工具箱）构建并分析大脑结构协变网络学习笔记

前言

前面我学习了利用DTI构建白质纤维脑网络，并采用GRETNA计算了小世界网络属性。阅读文献发现可以利用灰质体积或皮层指标（皮层厚度、折叠指数、沟深）等构建结构协变网络再进行网络拓扑属性的计算。因此，我采用前面提取的灰质体积和皮质数据进行了结构协变网络分析，特此写下笔记以便后面的学习。
GAT下载链接

一、数据准备

1.1提取ROI灰质体积
将前面分割得到的灰质文件（mwp1*）整理到一个文件中
利用GAT（图论分析工具箱）构建并分析大脑结构协变网络学习笔记_第1张图片
可以采用dpabi和restplus两个工具包提取ROI灰质体积，二者操作类似，因此下面只记录其一。操作步骤如下：
（1） 安装dpabi，下载dpabi安装包，打开MATLAB设置dpabi
（2） MATLAB命令行输入dpabi,打开dpabi,选择Utilities，再选择ROI Signal Extractor

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