数据挖掘组队学习之特征工程

同DataWhale一起组队学习:https://tianchi.aliyun.com/notebook-ai/detail?spm=5176.12281978.0.0.6802593a2HCrSE&postId=95501

特征工程,是进行数据挖掘的重要一环,包括处理异常值,特征归一化、标准化,数据分桶,缺失值处理等。

常见的特征工程包括:

  1. 异常处理:
    • 通过箱线图(或 3-Sigma)分析删除异常值;
    • BOX-COX 转换(处理有偏分布);
    • 长尾截断;
  2. 特征归一化/标准化:
    • 标准化(转换为标准正态分布);
    • 归一化(抓换到 [0,1] 区间);
    • 针对幂律分布,可以采用公式:
  3. 数据分桶:
    • 等频分桶;
    • 等距分桶;
    • Best-KS 分桶(类似利用基尼指数进行二分类);
    • 卡方分桶;
  4. 缺失值处理:
    • 不处理(针对类似 XGBoost 等树模型);
    • 删除(缺失数据太多);
    • 插值补全,包括均值/中位数/众数/建模预测/多重插补/压缩感知补全/矩阵补全等;
    • 分箱,缺失值一个箱;
  5. 特征构造:
    • 构造统计量特征,报告计数、求和、比例、标准差等;
    • 时间特征,包括相对时间和绝对时间,节假日,双休日等;
    • 地理信息,包括分箱,分布编码等方法;
    • 非线性变换,包括 log/ 平方/ 根号等;
    • 特征组合,特征交叉;
    • 仁者见仁,智者见智。
  6. 特征筛选
    • 过滤式(filter):先对数据进行特征选择,然后在训练学习器,常见的方法有 Relief/方差选择发/相关系数法/卡方检验法/互信息法;
    • 包裹式(wrapper):直接把最终将要使用的学习器的性能作为特征子集的评价准则,常见方法有 LVM(Las Vegas Wrapper) ;
    • 嵌入式(embedding):结合过滤式和包裹式,学习器训练过程中自动进行了特征选择,常见的有 lasso 回归;
  7. 降维
    • PCA/ LDA/ ICA;
    • 特征选择也是一种降维。

3.3 代码示例

3.3.0 导入数据

import pandas as pd
import numpy as np
import matplotlib
import matplotlib.pyplot as plt
import seaborn as sns
from operator import itemgetter

%matplotlib inline
path = './datalab/'
Train_data = pd.read_csv(path+'used_car_train_20200313.csv', sep=' ')
Test_data = pd.read_csv(path+'used_car_testA_20200313.csv', sep=' ')
print(Train_data.shape)
print(Test_data.shape)

output

(150000, 31)
(50000, 30)

3.3.1 删除异常值

下面封装的是利用箱线图去除异常值
上四分位数Q3 是指数据从小到大排列,取其3/4处位置的分位数
下四分位数Q1 是指数据从小到大排列,取其1/4处位置的分位数
IQR = Q3-Q1指的是四分位距,即上四分位数和下四分位数的差值
那我们认为的异常值是指之外的值,下面的封装就是实现了这个逻辑

def outliers_proc(data, col_name, scale=3):
    """
    用于清洗异常值,默认用 box_plot(scale=3)进行清洗
    :param data: 接收 pandas 数据格式
    :param col_name: pandas 列名
    :param scale: 尺度
    :return:
    """
    def box_plot_outliers(data_ser, box_scale):
        """
        利用箱线图去除异常值
        上四分位数Q3 = data_ser.quantile(0.75)
        下四分位数Q1 = data_ser.quantile(0.25)
        IQR = Q3-Q1指的是四分位距,即上四分位数和下四分位数的差值
        那我们认为的异常值是指[Q1-k*IQR,Q3-k*IQR]之外的值,而这里的k就是函数中的box_scale
        这个函数剔除的就是[Q1-k*IQR,Q3-k*IQR]
        :param data_ser: 接收 pandas.Series 数据格式
        :param box_scale: 箱线图尺度,
        :return:
        """
        iqr = box_scale * (data_ser.quantile(0.75) - data_ser.quantile(0.25))
        # 
        val_low = data_ser.quantile(0.25) - iqr
        val_up = data_ser.quantile(0.75) + iqr
        rule_low = (data_ser < val_low)
        rule_up = (data_ser > val_up)
        return (rule_low, rule_up), (val_low, val_up)

    data_n = data.copy()
    data_series = data_n[col_name]
    rule, value = box_plot_outliers(data_series, box_scale=scale)
    index = np.arange(data_series.shape[0])[rule[0] | rule[1]]
    print("Delete number is: {}".format(len(index)))
    data_n:pd.DataFrame = data_n.drop(index)
    data_n.reset_index(drop=True, inplace=True)
    print("Now column number is: {}".format(data_n.shape[0]))
    index_low = np.arange(data_series.shape[0])[rule[0]]
    outliers = data_series.iloc[index_low] # 看一看小于下边缘的数据
    print("Description of data less than the lower bound is:")
    print(pd.Series(outliers).describe())
    index_up = np.arange(data_series.shape[0])[rule[1]]
    outliers = data_series.iloc[index_up]  # 看一下大于下边缘的数据
    print("Description of data larger than the upper bound is:")
    print(pd.Series(outliers).describe())
    
    fig, ax = plt.subplots(1, 2, figsize=(10, 7))
    sns.boxplot(y=data[col_name], data=data, palette="Set1", ax=ax[0])
    sns.boxplot(y=data_n[col_name], data=data_n, palette="Set1", ax=ax[1])
    return data_n
# 我们可以删掉一些异常数据,以 power 为例。  
# 这里删不删同学可以自行判断
# 但是要注意 test 的数据不能删 = = 不能掩耳盗铃是不是

Train_data = outliers_proc(Train_data, 'power', scale=3)

output

Delete number is: 963
Now column number is: 149037
Description of data less than the lower bound is:
count    0.0
mean     NaN
std      NaN
min      NaN
25%      NaN
50%      NaN
75%      NaN
max      NaN
Name: power, dtype: float64
Description of data larger than the upper bound is:
count      963.000000
mean       846.836968
std       1929.418081
min        376.000000
25%        400.000000
50%        436.000000
75%        514.000000
max      19312.000000
Name: power, dtype: float64
数据挖掘之特征工程_7_1.png

3.3.2 特征构造

特征构造首先是要提取特征,提取哪些特征得看个人理解比如这几种:
- 构造统计量特征,报告计数、求和、比例、标准差等;
- 时间特征,包括相对时间和绝对时间,节假日,双休日等;
- 地理信息,包括分箱,分布编码等方法;

构造特征的时候,也可以进行非线性变换,包括 log/ 平方/ 根号等;

最后我们还可以进行特征组合,交叉等操作

# 训练集和测试集放在一起,方便构造特征
Train_data['train']=1
Test_data['train']=0
data = pd.concat([Train_data, Test_data], ignore_index=True)

对时间特征进行处理

# 使用时间:data['creatDate'] - data['regDate'],反应汽车使用时间,一般来说价格与使用时间成反比
# 不过要注意,数据里有时间出错的格式,所以我们需要 errors='coerce'
data['used_time'] = (pd.to_datetime(data['creatDate'], format='%Y%m%d', errors='coerce') - 
                            pd.to_datetime(data['regDate'], format='%Y%m%d', errors='coerce')).dt.days
# 看一下空数据,有 15k 个样本的时间是有问题的,我们可以选择删除,也可以选择放着。
# 但是这里不建议删除,因为删除缺失数据占总样本量过大,7.5%
# 我们可以先放着,因为如果我们 XGBoost 之类的决策树,其本身就能处理缺失值,所以可以不用管;
data['used_time'].head()

output

0    4385.0
1    4757.0
2    4382.0
3    7125.0
4    1531.0
Name: used_time, dtype: float64

查看非空值

data['used_time'].isnull().sum()

output

15072

加入了先验知识的特征提取

# 从邮编中提取城市信息,相当于加入了先验知识
data['city'] = data['regionCode'].apply(lambda x : str(x)[:-3])
data

提取一些统计量作为特征

# 计算某品牌的销售统计量,同学们还可以计算其他特征的统计量
# 这里要以 train 的数据计算统计量
Train_gb = Train_data.groupby("brand")
all_info = {}
for kind, kind_data in Train_gb:
    info = {}
    kind_data = kind_data[kind_data['price'] > 0]
    info['brand_amount'] = len(kind_data)
    info['brand_price_max'] = kind_data.price.max()
    info['brand_price_median'] = kind_data.price.median()
    info['brand_price_min'] = kind_data.price.min()
    info['brand_price_sum'] = kind_data.price.sum()
    info['brand_price_std'] = kind_data.price.std()
    info['brand_price_average'] = round(kind_data.price.sum() / (len(kind_data) + 1), 2)
    all_info[kind] = info
brand_fe = pd.DataFrame(all_info).T.reset_index().rename(columns={"index": "brand"})
data = data.merge(brand_fe, how='left', on='brand')  # 左连接,根据brand来合并
data.head()

数据分桶也是一种特征处理的方式

# 数据分桶 以 power 为例
# 这时候我们的缺失值也进桶了,
# 为什么要做数据分桶呢,原因有很多,= =
# 1. 离散后稀疏向量内积乘法运算速度更快,计算结果也方便存储,容易扩展;
# 2. 离散后的特征对异常值更具鲁棒性,如 age>30 为 1 否则为 0,对于年龄为 200 的也不会对模型造成很大的干扰;
# 3. LR 属于广义线性模型,表达能力有限,经过离散化后,每个变量有单独的权重,这相当于引入了非线性,能够提升模型的表达能力,加大拟合;
# 4. 离散后特征可以进行特征交叉,提升表达能力,由 M+N 个变量编程 M*N 个变量,进一步引入非线形,提升了表达能力;
# 5. 特征离散后模型更稳定,如用户年龄区间,不会因为用户年龄长了一岁就变化

# 当然还有很多原因,LightGBM 在改进 XGBoost 时就增加了数据分桶,增强了模型的泛化性

bin = [i*10 for i in range(31)]
data['power_bin'] = pd.cut(data['power'], bin, labels=False)
data[['power_bin', 'power']].head()
# 删除不需要的数据
data = data.drop(['creatDate', 'regDate', 'regionCode'], axis=1)
print(data.shape)
data.columns

output

(199037, 39)
Index(['SaleID', 'bodyType', 'brand', 'fuelType', 'gearbox', 'kilometer',
       'model', 'name', 'notRepairedDamage', 'offerType', 'power', 'price',
       'seller', 'train', 'v_0', 'v_1', 'v_10', 'v_11', 'v_12', 'v_13', 'v_14',
       'v_2', 'v_3', 'v_4', 'v_5', 'v_6', 'v_7', 'v_8', 'v_9', 'used_time',
       'city', 'brand_amount', 'brand_price_max', 'brand_price_median',
       'brand_price_min', 'brand_price_sum', 'brand_price_std',
       'brand_price_average', 'power_bin'],
      dtype='object')
# 目前的数据其实已经可以给树模型使用了,所以我们导出一下
import os
if not os.path.exists('data_for_tree.csv'):
    data.to_csv('data_for_tree.csv', index=0)

用长尾分布截断处理异常值

# 我们可以再构造一份特征给 LR NN 之类的模型用
# 之所以分开构造是因为,不同模型对数据集的要求不同
# 我们看下数据分布:
data['power'].plot.hist()
数据挖掘之特征工程_24_1.png
# 我们刚刚已经对 train 进行异常值处理了,但是现在还有这么奇怪的分布是因为 test 中的 power 异常值,
# 所以我们其实刚刚 train 中的 power 异常值不删为好,可以用长尾分布截断来代替
Train_data['power'].plot.hist()
数据挖掘之特征工程_25_1.png
# 我们对其取 log,在做归一化
from sklearn import preprocessing
min_max_scaler = preprocessing.MinMaxScaler()
data['power'] = np.log(data['power'] + 1) 
data['power'] = ((data['power'] - np.min(data['power'])) / (np.max(data['power']) - np.min(data['power'])))
data['power'].plot.hist()
数据挖掘之特征工程_26_1.png
# km 的比较正常,应该是已经做过分桶了
data['kilometer'].plot.hist()
数据挖掘之特征工程_27_1.png
# 所以我们可以直接做归一化
data['kilometer'] = ((data['kilometer'] - np.min(data['kilometer'])) / 
                        (np.max(data['kilometer']) - np.min(data['kilometer'])))
data['kilometer'].plot.hist()
数据挖掘之特征工程_28_1.png
# 除此之外 还有我们刚刚构造的统计量特征:
# 'brand_amount', 'brand_price_average', 'brand_price_max',
# 'brand_price_median', 'brand_price_min', 'brand_price_std',
# 'brand_price_sum'
# 这里不再一一举例分析了,直接做变换,
def max_min(x):
    return (x - np.min(x)) / (np.max(x) - np.min(x))

data['brand_amount'] = ((data['brand_amount'] - np.min(data['brand_amount'])) / 
                        (np.max(data['brand_amount']) - np.min(data['brand_amount'])))
data['brand_price_average'] = ((data['brand_price_average'] - np.min(data['brand_price_average'])) / 
                               (np.max(data['brand_price_average']) - np.min(data['brand_price_average'])))
data['brand_price_max'] = ((data['brand_price_max'] - np.min(data['brand_price_max'])) / 
                           (np.max(data['brand_price_max']) - np.min(data['brand_price_max'])))
data['brand_price_median'] = ((data['brand_price_median'] - np.min(data['brand_price_median'])) /
                              (np.max(data['brand_price_median']) - np.min(data['brand_price_median'])))
data['brand_price_min'] = ((data['brand_price_min'] - np.min(data['brand_price_min'])) / 
                           (np.max(data['brand_price_min']) - np.min(data['brand_price_min'])))
data['brand_price_std'] = ((data['brand_price_std'] - np.min(data['brand_price_std'])) / 
                           (np.max(data['brand_price_std']) - np.min(data['brand_price_std'])))
data['brand_price_sum'] = ((data['brand_price_sum'] - np.min(data['brand_price_sum'])) / 
                           (np.max(data['brand_price_sum']) - np.min(data['brand_price_sum'])))
# 对类别特征进行 OneEncoder
data = pd.get_dummies(data, columns=['model', 'brand', 'bodyType', 'fuelType',
                                     'gearbox', 'notRepairedDamage', 'power_bin'])
print(data.shape)
data.columns
(199037, 370)
Index(['SaleID', 'kilometer', 'name', 'offerType', 'power', 'price', 'seller',
       'train', 'v_0', 'v_1',
       ...
       'power_bin_20.0', 'power_bin_21.0', 'power_bin_22.0', 'power_bin_23.0',
       'power_bin_24.0', 'power_bin_25.0', 'power_bin_26.0', 'power_bin_27.0',
       'power_bin_28.0', 'power_bin_29.0'],
      dtype='object', length=370)
# 这份数据可以给 LR 用
if not os.path.exists('data_for_lr.csv'):
    data.to_csv('data_for_lr.csv', index=0)

3.3.3 特征筛选

1) 过滤式

过滤式特征选择与学习器无关,只利用数据集本身的性质和个人的理解,过滤式选择的方法有:

  1. 移除低方差的特征;
  2. 相关系数排序,分别计算每个特征与输出值之间的相关系数,设定一个阈值,选择相关系数大于阈值的部分特征;
  3. 利用假设检验得到特征与输出值之间的相关性,方法有比如卡方检验、t检验、F检验等。
  4. 互信息,利用互信息从信息熵的角度分析相关性。
# 相关性分析
print(data['power'].corr(data['price'], method='spearman'))
print(data['kilometer'].corr(data['price'], method='spearman'))
print(data['brand_amount'].corr(data['price'], method='spearman'))
print(data['brand_price_average'].corr(data['price'], method='spearman'))
print(data['brand_price_max'].corr(data['price'], method='spearman'))
print(data['brand_price_median'].corr(data['price'], method='spearman'))
0.5728285196051496
-0.4082569701616764
0.058156610025581514
0.3834909576057687
0.259066833880992
0.38691042393409447

# 当然也可以直接看图
data_numeric = data[['power', 'kilometer', 'brand_amount', 'brand_price_average', 
                     'brand_price_max', 'brand_price_median']]
correlation = data_numeric.corr()

f , ax = plt.subplots(figsize = (7, 7))
plt.title('Correlation of Numeric Features with Price',y=1,size=16)
sns.heatmap(correlation,square = True,  vmax=0.8)

output

数据挖掘之特征工程_36_1.png

2) 包裹式

包裹式从初始特征集合中不断的选择特征子集,训练学习器,根据学习器的性能来对子集进行评价,直到选择出最佳的子集。

包裹式特征选择直接针对给定学习器进行优化。

优点:从最终学习器的性能来看,包裹式比过滤式更好;

缺点:由于特征选择过程中需要多次训练学习器,因此包裹式特征选择的计算开销通常比过滤式特征选择要大得多。

SFS(序列化选择),SBS(序列化向后选择),SFFS(序列化浮动前进选择)都属于序列选择算法。SFS以空集开始,每次添加1个特征,使的当前目标函数值增加的最大,这样反复循环,直到特征个数达到预定要求。SBS则以特征全集,每次去掉1个特征,使得当前目标函数减少的最小,反复循环,直到特征个数达到预定要求。SFFS也是从空集开始,每次添加1个特征,使得当前目标函数增加的最大,同时检验是否能够减少某个特征使得目标函数也增加,如果有这样的特征,则从集合中去掉;如果找不到,则继续添加特征的过程,直到特征个数达到预定要求

RFE是sklearn里面的递归特征消除,递归特征消除的主要思想是反复构建模型,然后选出最好的(或者最差的)特征(根据系数来选),把选出来的特征放到一边,然后在剩余的特征上重复这个过程,直到遍历了所有的特征。在这个过程中被消除的次序就是特征的排序

# k_feature 太大会很难跑,没服务器,所以提前 interrupt 了
from mlxtend.feature_selection import SequentialFeatureSelector as SFS
from sklearn.linear_model import LinearRegression
sfs = SFS(LinearRegression(),
           k_features=10,
           forward=True,
           floating=False,
           scoring = 'r2',
           cv = 0)
x = data.drop(['price'], axis=1)
x = x.fillna(0)
y = data['price']
sfs.fit(x, y)
sfs.k_feature_names_ 
# 画出来,可以看到边际效益
from mlxtend.plotting import plot_sequential_feature_selection as plot_sfs
import matplotlib.pyplot as plt
fig1 = plot_sfs(sfs.get_metric_dict(), kind='std_dev')
plt.grid()
plt.show()

3) 嵌入式

嵌入式特征选择是将特征选择过程与学习器训练过程融为一体,两者在同一个优化过程中完成,即在学习器训练过程中自动地进行了特征选择。

嵌入式选择最常用的是L1、正则化和L2

正则化(关于正则化,详见之前的博客【机器学习】一文读懂正则化与LASSO回归,Ridge回归)。

正则化项越大,模型越简单,系数越小,当正则化项增大到一定程度时,所有的特征系数都会趋于0,在这个过程中,会有一部分特征的系数先变成0。也就实现了特征选择过程。

逻辑回归、线性回归、决策树都可以当作正则化选择特征的基学习器,只有可以得到特征系数或者可以得到特征重要度的算法才可以作为嵌入式选择的基学习器。

3.4 经验总结

特征工程是比赛中最至关重要的的一块,特别的传统的比赛,大家的模型可能都差不多,调参带来的效果增幅是非常有限的,但特征工程的好坏往往会决定了最终的排名和成绩。

特征工程的主要目的还是在于将数据转换为能更好地表示潜在问题的特征,从而提高机器学习的性能。比如,异常值处理是为了去除噪声,填补缺失值可以加入先验知识等。

特征构造也属于特征工程的一部分,其目的是为了增强数据的表达。

有些比赛的特征是匿名特征,这导致我们并不清楚特征相互直接的关联性,这时我们就只有单纯基于特征进行处理,比如装箱,groupby,agg 等这样一些操作进行一些特征统计,此外还可以对特征进行进一步的 log,exp 等变换,或者对多个特征进行四则运算(如上面我们算出的使用时长),多项式组合等然后进行筛选。由于特性的匿名性其实限制了很多对于特征的处理,当然有些时候用 NN 去提取一些特征也会达到意想不到的良好效果。

对于知道特征含义(非匿名)的特征工程,特别是在工业类型比赛中,会基于信号处理,频域提取,丰度,偏度等构建更为有实际意义的特征,这就是结合背景的特征构建,在推荐系统中也是这样的,各种类型点击率统计,各时段统计,加用户属性的统计等等,这样一种特征构建往往要深入分析背后的业务逻辑或者说物理原理,从而才能更好的找到 magic。

当然特征工程其实是和模型结合在一起的,这就是为什么要为 LR NN 做分桶和特征归一化的原因,而对于特征的处理效果和特征重要性等往往要通过模型来验证。

总的来说,特征工程是一个入门简单,但想精通非常难的一件事。

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