小组学习DAY6-ZZW

内容来自生信星球

R包与小抄

• R包
• 小抄（cheatsheet）：R包的说明书，操作指南
  获取方法：
  方法1：去百度/谷歌XX小抄
  方法2：找Rstudio的cheatsheet网站
  https://www.rstudio.com/resources/cheatsheets/

安装R包

• install.packages("R包")
• 直到出现<，表示安装成功
  可能出现的问题：
  1.换一个镜像
  
  
  方法
  
  
  

加载R包

• library(R包)

关于数据框

1.新建数据框
a<-data.frame(GeneId = rep("gene5",times=3),SampleName =paste("Sample",1:3,sep=""),Expression=c(14,19,18))

• rep，重复，括号中填要重复的字符和重复次数。
• paste，连接两个字符串，括号要填两个代连接字符并指定分隔符（sep），没有分隔符就填sep=“”。
• 1：3表示从1到三。如需一列中需要填入三个无规律的数字，可以用向量c(1，3，4)，同样如果填的是字符串也需要加双引号，例如c("doudou","huahua","xiaoyu")。
• 了解概念：key-value--“键值对” ，表示一种对应关系。“键”和“值”都是列名，如SampleName和Expression的对应
  括号里是“列名”=列值，这里列名要加双引号
  得到的数据框
  
  
  
  实际操作

tidydata

• 一种组织表格数据的方式
• 提供了一种能够跨包使用的“统一”的数据格式

• 什么叫“统一”？
  每个变量（variable）占一列，每个情况（case）和观测值（observation）占一行

  
  
  处理前
  
  
  处理后
  
  

  1.Reshape Data
  2.Handle Missing Values

3. Expand Tables

思维导图

R包使用.png