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Day2-xiaode

二代测序数据的分析

学习目标

  • 解释测序技术如何形成NGS
  • 描述FASTQ、SAM/BAM和VCF数据格式
  • 比较将NGS数据与参考基因组对比的各种方法
  • 描述基因组变异的类型及其定义过程
  • 解释对比、组装和变异识别中的错误
  • 解释预测某个基因组中变异的功能后果方法

DNA测序技术

  • Sanger测序(双脱氧核苷酸测序)
  • 二代测序技术（NGS）

Linux的基本原则

  • 由目的单一的小程序组成，组合小程序完成复杂任务
  • 一切皆文件
  • 尽量避免捕获用户接口
  • 配置文件保存为纯文本格式
    CL1接口；
    命令提示符：prompt，bash（shell）

命令格式：
命令 选项 （对命令进行调控）

短选项;-（多个选项可以组合，中间那需要有空格隔开)
长选项：--

3.参数;命令作用的对象

  • linux系统使用


    Linux练习操作.png
学习思维导图
linux.png

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