在Pytorch中使用Mask R-CNN进行实例分割操作

在这篇文章中,我们将讨论mask R-CNN背后的一些理论,以及如何在PyTorch中使用预训练的mask R-CNN模型。

1.语义分割、目标检测和实例分割

之前已经介绍过:

1、语义分割:在语义分割中,我们分配一个类标签(例如。狗、猫、人、背景等)对图像中的每个像素。

2、目标检测:在目标检测中,我们将类标签分配给包含对象的包围框。

一个非常自然的想法是把两者结合起来。我们只想在一个对象周围识别一个包围框,并且找到包围框中的哪些像素属于对象。 换句话说,我们想要一个掩码,它指示(使用颜色或灰度值)哪些像素属于同一对象。 产生上述掩码的一类算法称为实例分割算法。mask R-CNN就是这样一种算法。

实例分割和语义分割有两种不同

1、在语义分割中,每个像素都被分配一个类标签,而在实例分割中则不是这样。

2、在语义分割中,我们不区分同一类的实例。例如,语义分割中属于“Person”类的所有像素都将在掩码中分配相同的颜色/值。在实例分割中,它们被分配到不同的值,我们能够告诉它们哪个像素对应于哪个人。 要了解更多关于图像分割的信息,请查看我们已经详细解释过的帖子。

Mask R-CNN结构

mask R-CNN的网络结构是我们以前讨论过的FasterR-CNN的扩展。

回想一下,faster R-CNN架构有以下组件

卷积层:输入图像经过几个卷积层来创建特征图。如果你是初学者,把卷积层看作一个黑匣子,它接收一个3通道的输入图像,并输出一个空间维数小得多(7×7),但通道非常多(512)的“图像”。

区域提案网络(RPN)。卷积层的输出用于训练一个网络,该网络提取包围对象的区域。

分类器:同样的特征图也被用来训练一个分类器,该分类器将标签分配给框内的对象。

此外,回想一下,FasterR-CNN 比 Fast R-CNN更快,因为特征图被计算一次,并被RPN和分类器重用。 mask R-CNN将这个想法向前推进了一步。除了向RPN和分类器提供特征图外,mask R-CNN还使用它来预测边界框内对象的二值掩码。 研究 MaskR-CNN的掩码预测部分的一种方法是,它是一个用于语义分割的完全卷积网络(FCN)。唯一的区别是在mask R-CNN里,FCN被应用于边界框,而且它与RPN和分类器共享卷积层。 下图显示了一个非常高层次的架构。


2.在PyTorch中使用mask R-CNN[代码]

在本节中,我们将学习如何在PyTorch中使用预先训练的MaskR-CNN模型。

2.1.输入和输出

mask R-CNN模型期望的输入是张量列表,每个张量的类型为(n,c,h,w),元素在0-1范围内。图像的大小随意。

n是图像的个数

c为通道数 RGB图像为3

h是图像的高度

w是图像的宽度

模型返回 :

包围框的坐标

模型预测的存在于输入图像中的类的标签以及对应标签的分数

标签中每个类的掩码。

2.2 预训练模型

model = torchvision.models.detection.maskrcnn_resnet50_fpn(pretrained=True)

model.eval()

2.3 模型的预测

COCO_INSTANCE_CATEGORY_NAMES = [

'__background__', 'person', 'bicycle', 'car', 'motorcycle', 'airplane', 'bus',

'train', 'truck', 'boat', 'traffic light', 'fire hydrant', 'N/A', 'stop sign',

'parking meter', 'bench', 'bird', 'cat', 'dog', 'horse', 'sheep', 'cow',

'elephant', 'bear', 'zebra', 'giraffe', 'N/A', 'backpack', 'umbrella', 'N/A', 'N/A',

'handbag', 'tie', 'suitcase', 'frisbee', 'skis', 'snowboard', 'sports ball',

'kite', 'baseball bat', 'baseball glove', 'skateboard', 'surfboard', 'tennis racket',

'bottle', 'N/A', 'wine glass', 'cup', 'fork', 'knife', 'spoon', 'bowl',

'banana', 'apple', 'sandwich', 'orange', 'broccoli', 'carrot', 'hot dog', 'pizza',

'donut', 'cake', 'chair', 'couch', 'potted plant', 'bed', 'N/A', 'dining table',

'N/A', 'N/A', 'toilet', 'N/A', 'tv', 'laptop', 'mouse', 'remote', 'keyboard', 'cell phone',

'microwave', 'oven', 'toaster', 'sink', 'refrigerator', 'N/A', 'book',

'clock', 'vase', 'scissors', 'teddy bear', 'hair drier', 'toothbrush'

]


def get_prediction(img_path, threshold):

img = Image.open(img_path)

transform = T.Compose([T.ToTensor()])

img = transform(img)

pred = model([img])

print('pred')

print(pred)

pred_score = list(pred[0]['scores'].detach().numpy())

pred_t = [pred_score.index(x) for x in pred_score if x>threshold][-1]

print("masks>0.5")

print(pred[0]['masks']>0.5)

masks = (pred[0]['masks']>0.5).squeeze().detach().cpu().numpy()

print("this is masks")

print(masks)

pred_class = [COCO_INSTANCE_CATEGORY_NAMES[i] for i in list(pred[0]['labels'].numpy())]

pred_boxes = [[(i[0], i[1]), (i[2], i[3])] for i in list(pred[0]['boxes'].detach().numpy())]

masks = masks[:pred_t+1]

pred_boxes = pred_boxes[:pred_t+1]

pred_class = pred_class[:pred_t+1]

return masks, pred_boxes, pred_class

代码功能如下:

从图像路径中获取图像

使用PyTorch变换将图像转换为图像张量

通过模型传递图像以得到预测结果

从模型中获得掩码、预测类和包围框坐标

每个预测对象的掩码从一组11个预定义的颜色中随机给出颜色,以便在输入图像上将掩码可视化。

def random_colour_masks(image):

colours = [[0, 255, 0],[0, 0, 255],[255, 0, 0],[0, 255, 255],[255, 255, 0],[255, 0, 255],[80, 70, 180],[250, 80, 190],[245, 145, 50],[70, 150, 250],[50, 190, 190]]

r = np.zeros_like(image).astype(np.uint8)

g = np.zeros_like(image).astype(np.uint8)

b = np.zeros_like(image).astype(np.uint8)

r[image == 1], g[image == 1], b[image == 1] = colours[random.randrange(0,10)]

coloured_mask = np.stack([r, g, b], axis=2)

return coloured_mask

代码中有一些打印信息帮助分析处理过程

2.4 实例分割工作流程

def instance_segmentation_api(img_path, threshold=0.5, rect_th=3, text_size=3, text_th=3):

masks, boxes, pred_cls = get_prediction(img_path, threshold)

img = cv2.imread(img_path)

img = cv2.cvtColor(img, cv2.COLOR_BGR2RGB)

for i in range(len(masks)):

rgb_mask = random_colour_masks(masks[i])

img = cv2.addWeighted(img, 1, rgb_mask, 0.5, 0)

cv2.rectangle(img, boxes[i][0], boxes[i][1],color=(0, 255, 0), thickness=rect_th)

cv2.putText(img,pred_cls[i], boxes[i][0], cv2.FONT_HERSHEY_SIMPLEX, text_size, (0,255,0),thickness=text_th)

plt.figure(figsize=(20,30))

plt.imshow(img)

plt.xticks([])

plt.yticks([])

plt.show()

掩码、预测类和边界框是通过get_prediction获得的

每个掩码从11种颜色中随机给出颜色。 每个掩码按比例1:0.5被添加到图像中,使用了opencv。

包围框是用cv2.rectangle绘制的,上面有类名。

显示最终输出

完整代码如下:

from PIL import Image

import matplotlib.pyplot as plt

import torch

import torchvision.transforms as T

import torchvision

import torch

import numpy as np

import cv2

import random


model = torchvision.models.detection.maskrcnn_resnet50_fpn(pretrained=True)

model.eval()

COCO_INSTANCE_CATEGORY_NAMES = [

'__background__', 'person', 'bicycle', 'car', 'motorcycle', 'airplane', 'bus',

'train', 'truck', 'boat', 'traffic light', 'fire hydrant', 'N/A', 'stop sign',

'parking meter', 'bench', 'bird', 'cat', 'dog', 'horse', 'sheep', 'cow',

'elephant', 'bear', 'zebra', 'giraffe', 'N/A', 'backpack', 'umbrella', 'N/A', 'N/A',

'handbag', 'tie', 'suitcase', 'frisbee', 'skis', 'snowboard', 'sports ball',

'kite', 'baseball bat', 'baseball glove', 'skateboard', 'surfboard', 'tennis racket',

'bottle', 'N/A', 'wine glass', 'cup', 'fork', 'knife', 'spoon', 'bowl',

'banana', 'apple', 'sandwich', 'orange', 'broccoli', 'carrot', 'hot dog', 'pizza',

'donut', 'cake', 'chair', 'couch', 'potted plant', 'bed', 'N/A', 'dining table',

'N/A', 'N/A', 'toilet', 'N/A', 'tv', 'laptop', 'mouse', 'remote', 'keyboard', 'cell phone',

'microwave', 'oven', 'toaster', 'sink', 'refrigerator', 'N/A', 'book',

'clock', 'vase', 'scissors', 'teddy bear', 'hair drier', 'toothbrush'

]

def get_prediction(img_path, threshold):

img = Image.open(img_path)

transform = T.Compose([T.ToTensor()])

img = transform(img)

pred = model([img])

print('pred')

print(pred)

pred_score = list(pred[0]['scores'].detach().numpy())

pred_t = [pred_score.index(x) for x in pred_score if x>threshold][-1]

print("masks>0.5")

print(pred[0]['masks']>0.5)

masks = (pred[0]['masks']>0.5).squeeze().detach().cpu().numpy()

print("this is masks")

print(masks)

pred_class = [COCO_INSTANCE_CATEGORY_NAMES[i] for i in list(pred[0]['labels'].numpy())]

pred_boxes = [[(i[0], i[1]), (i[2], i[3])] for i in list(pred[0]['boxes'].detach().numpy())]

masks = masks[:pred_t+1]

pred_boxes = pred_boxes[:pred_t+1]

pred_class = pred_class[:pred_t+1]

return masks, pred_boxes, pred_class


def random_colour_masks(image):

colours = [[0, 255, 0],[0, 0, 255],[255, 0, 0],[0, 255, 255],[255, 255, 0],[255, 0, 255],[80, 70, 180],[250, 80, 190],[245, 145, 50],[70, 150, 250],[50, 190, 190]]

r = np.zeros_like(image).astype(np.uint8)

g = np.zeros_like(image).astype(np.uint8)

b = np.zeros_like(image).astype(np.uint8)

r[image == 1], g[image == 1], b[image == 1] = colours[random.randrange(0,10)]

coloured_mask = np.stack([r, g, b], axis=2)

return coloured_mask


def instance_segmentation_api(img_path, threshold=0.5, rect_th=3, text_size=3, text_th=3):

masks, boxes, pred_cls = get_prediction(img_path, threshold)

img = cv2.imread(img_path)

img = cv2.cvtColor(img, cv2.COLOR_BGR2RGB)

for i in range(len(masks)):

rgb_mask = random_colour_masks(masks[i])

img = cv2.addWeighted(img, 1, rgb_mask, 0.5, 0)

cv2.rectangle(img, boxes[i][0], boxes[i][1],color=(0, 255, 0), thickness=rect_th)

cv2.putText(img,pred_cls[i], boxes[i][0], cv2.FONT_HERSHEY_SIMPLEX, text_size, (0,255,0),thickness=text_th)

plt.figure(figsize=(20,30))

plt.imshow(img)

plt.xticks([])

plt.yticks([])

plt.show()

2.5 示例

示例1:以小鸡为例,会识别为鸟类

instance_segmentation_api('chicken.jpg')

输入图像:

输出结果:

处理过程中的打印信息:

pred

[{'boxes': tensor([[176.8106, 125.6315, 326.8023, 400.4467],

[427.9514, 130.5811, 584.2725, 403.1004],

[289.9471, 169.1313, 448.9896, 410.0000],

[208.7829, 140.7450, 421.3497, 409.0258],

[417.7833, 137.5480, 603.2806, 405.6804],

[174.3626, 132.7247, 330.4560, 404.6956],

[291.6709, 165.4233, 447.1820, 401.7686],

[171.9978, 114.4133, 336.9987, 410.0000],

[427.0312, 129.5812, 584.2130, 405.4166]], grad_fn=), 'labels': tensor([16, 16, 16, 16, 20, 20, 20, 18, 18]), 'scores': tensor([0.9912, 0.9910, 0.9894, 0.2994, 0.2108, 0.1995, 0.1795, 0.1655, 0.0516],

grad_fn=), 'masks': tensor([[[[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

...,

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.]]],


[[[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

...,

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.]]],


[[[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

...,

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.]]],


...,


[[[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

...,

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.]]],


[[[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

...,

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.]]],


[[[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

...,

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.]]]], grad_fn=)}]

masks>0.5

tensor([[[[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False],

...,

[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False]]],


[[[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False],

...,

[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False]]],


[[[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False],

...,

[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False]]],


...,


[[[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False],

...,

[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False]]],


[[[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False],

...,

[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False]]],


[[[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False],

...,

[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False]]]])

this is masks

[[[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]

...

[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]]


[[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]

...

[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]]


[[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]

...

[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]]


...


[[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]

...

[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]]


[[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]

...

[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]]


[[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]

...

[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]]]

masks = (pred[0]['masks']>0.5).squeeze().detach().cpu().numpy()使masks变为[n x h x w],且元素为bool值,为后续指定随机颜色做了准备,r[image == 1], g[image == 1], b[image == 1] = colours[random.randrange(0,10)],将掩码列表中属于实际对象的区域变成随机彩色,其余部分仍为0.这些代码充分展示了python中高级切片的魔力,当然用到的是numpy和torch.tensor里的功能。

示例2:棕熊

instance_segmentation_api('bear.jpg', threshold=0.8)

输入图像:

输出图像:

打印信息:

pred

[{'boxes': tensor([[ 660.3120, 340.5351, 1235.1614, 846.9672],

[ 171.7622, 426.9127, 756.6520, 784.9360],

[ 317.9777, 184.6863, 648.0856, 473.6469],

[ 283.0787, 200.8575, 703.7324, 664.4083],

[ 354.9362, 308.0444, 919.0403, 812.0120]], grad_fn=), 'labels': tensor([23, 23, 23, 23, 23]), 'scores': tensor([0.9994, 0.9994, 0.9981, 0.5138, 0.0819], grad_fn=), 'masks': tensor([[[[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

...,

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.]]],


[[[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

...,

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.]]],


[[[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

...,

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.]]],


[[[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

...,

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.]]],


[[[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

...,

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.],

[0., 0., 0., ..., 0., 0., 0.]]]], grad_fn=)}]

masks>0.5

tensor([[[[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False],

...,

[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False]]],


[[[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False],

...,

[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False]]],


[[[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False],

...,

[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False]]],


[[[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False],

...,

[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False]]],


[[[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False],

...,

[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False],

[False, False, False, ..., False, False, False]]]])

this is masks

[[[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]

...

[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]]


[[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]

...

[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]]


[[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]

...

[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]]


[[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]

...

[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]]


[[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]

...

[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]

[False False False ... False False False]]]

3、GPU与CPU时间对比

def check_inference_time(image_path, gpu=False):

model = torchvision.models.detection.maskrcnn_resnet50_fpn(pretrained=True)

model.eval()

img = Image.open(image_path)

transform = T.Compose([T.ToTensor()])

img = transform(img)

if gpu:

model.cuda()

img = img.cuda()

else:

model.cpu()

img = img.cpu()

start_time = time.time()

pred = model([img])

end_time = time.time()

return end_time-start_time


cpu_time = sum([check_inference_time('./people.jpg', gpu=False) for _ in range(5)])/5.0

gpu_time = sum([check_inference_time('./people.jpg', gpu=True) for _ in range(5)])/5.0

print('\\n\\nAverage Time take by the model with GPU = {}s\\nAverage Time take by the model with CPU = {}s'.format(gpu_time, cpu_time))

结果:

Average Time take by the model with GPU = 0.5736178874969482s,

Average Time take by the model with CPU = 10.966966199874879s

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