conda使用R语言--安装（Ubuntu）

在conda中使用R语言可以避免很多问题，更方便，特别是在无root权限时

首先下载miniconda，https://docs.conda.io/projects/miniconda/en/latest/
sh安装后source一下或者重进一下

是否自动进入conda环境

conda config --set auto_activate_base true      #false则不自动进入

不自动进入需每次激活环境

conda activate
conda deactivate      #退出

配置国内镜像源，conda config

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --set show_channels-urls yes
conda config --show channels      #查看配置的镜像源

安装软件conda install
以安装smatools为例

conda search smatools
conda install smatools
conda install smatools=1.7      #指定版本

创建虚拟环境

conda create -n R      # -n后面加任意你喜欢的环境名称
conda info --envs      #查看已创建的环境
conda activate R       #进入创建的环境

安装R语言

conda install R
conda activate R      #进入创建的环境
conda deactivate      #退出

删除环境

conda remove -n env_name --all

Tips：搜索conda cheatsheet可查看conda使用说明