能导致种猪群的繁殖障碍以及断奶仔猪和青年猪的呼吸道疾病。巨噬细胞并不能破坏PRRS病毒，相反能在巨噬细胞中增殖，产生大量病毒，并破坏肺巨噬细胞，多达40%的巨噬细胞被破坏，因此机体的主要防线被打破，使得其他细菌和病毒在机体中增殖。生长/育肥猪感染PRRS后，支原体肺炎明显加重，如果猪群中存在强毒力的2型猪链球菌，感染PRRSV使得脑膜炎发病率大幅度提高。猪群一旦感染，尽管临床上时强时弱，但病毒可能长期存在。
猪群内PRRSV持续存在与以下因素有关:
定期引进未感染的阴性后备猪进入猪群，可能使感染持续发生。病毒由前批次已经感染的猪传染给刚断奶的仔猪（由于母源抗体消失），这也许是许多猪场持续存在呼吸道疾病的原因。尽管病毒传播速度非常快，但对于较大规模猪群来说，病毒首次感染全群甚至需要一年时间，需要4-5个月时间猪群中90%的母猪血清学发生转阳。
传播方式:鼻腔分泌物，唾液，粪便，尿液以及空气传播，传播距离2千米以上，猪带毒状态长达3-5个月且不断排毒。带毒猪转群，随空气传播长达1千米，粪便、灰尘、水滴及污染的设备，污染的靴子和衣服，冬季可通过汽车轮毂的冰传播，野鸭或其他鸟类蚊子苍蝇，人工授精。
猪群健康程度越高感染后发病程度越轻，取决于猪群中已经存在的其他病毒和细菌及其致病性，而且当猪群的免疫力受到损伤时饲养密度和环境质量就尤为重要，例如健康猪感染PRRSV时不一定发生明显的肺炎，但是如果猪已经感染了某些呼吸道病原体且猪舍条件很差，就会爆发更为严重的疾病，并持久存在。
急性疾病:当蓝耳病初次侵入种猪群时，疾病可发生在空怀妊娠哺乳母猪和哺乳仔猪中，种猪群在感染初期出现食欲减退和发热通常会持续3-6周，部分母猪会出现咳漱，个别母猪会出现肺炎症状，这种急性期的症状在猪群中会持续大约6周，以早产和死胎增多，弱仔和胎儿在妊娠最后3周死亡后变成木乃伊比例升高为特征。某些猪群中，这些问题还会影响多达30%的新生仔猪，仔猪死亡率在出现症状的第三周或第四周达到70%的高峰，8-12周才会恢复到发病前的水平，需要4-8个月繁殖性能才能回复正常，蓝耳病偶尔也会出现皮肤损伤，在身体不同部位出现散发性小水泡，尤其是鼻子周围和肩部，水泡破裂后会感染，损伤部位随后变黑，最终愈合需要至少3周。
如果蓝耳已明确滞留于猪群中，在发病12个月后，蓝耳对猪群繁殖效率的影响有明确的结论:
分娩率降低10-15%，产活仔数减少，死胎增加，后备母猪繁殖力降低，早产，流产增加（一般升高2-3%，也有报道增加了50%），母猪分娩后厌食。
在蓝耳急性发病平息后，引起的繁殖障碍会持续6个月之久，有规则和无规则返情率升高5-10%，还会引起周期性的繁殖障碍。
公猪感染后临床症状呈多样性，如果有症状，会出现厌食，体温升高，精神不振，性欲减退，受精率降低，窝产仔数减少。
PRRSV首次入侵猪群时，引发的临床症状会与伪狂犬相混淆，但是仔猪发生猪繁殖与呼吸综合征后不会出现神经症状，血清学可以区分这两种病。最重要的是在感染的急性期要抑制细菌，一旦确认或怀疑，所有公猪和母猪应该用包括泰妙菌素在内的抗生素连续给药3-4周，也可饮水使用阿司匹林，及时治疗可以降低流产，死胎，木乃伊胎和二次感染引起的早产。母猪接种疫苗可减少病毒排毒，泰妙菌素能抑制PRRSV侵入巨噬细胞。
急性发病期配种区母猪的控制程序:空怀后备母猪采用相同的程序，6周内不要淘汰任何母猪达到配种目标，接受产子率下降10-15%的事实，增加后备母猪数量或减少淘汰母猪数量，从已经感染过PRRSV的猪场购买后备母猪，如果自留尽早感染。如果有疫苗考虑对引进的后备母猪进行免疫接种，后母猪与病毒接触或免疫6周才能配种，饮水中加入阿司匹林。
PRRSV活疫苗适用于断奶仔猪和非怀孕母猪。37度存活时间很短。