2020-05-11

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大肠癌诊断和治疗的生物标志物和靶点

癌细胞糖酵解途径的异常激活,癌细胞在糖酵解过程中表现出糖酵解活化,产生更多的乳酸,这些乳酸被输送到微环境中,导致糖酵解代谢过程中细胞外pH值降低。高的糖酵解率和低的微环境pH值与CRC患者的预后不良相关,并且与恶性特征增加相关,包括癌细胞增殖和转移。

lncRNAs、HOTAIR、MEG3、MALAT-1、H19和GClnc1可能在致癌中起作用,lincRNA-p21

lncRNAs在结直肠癌发生和糖代谢中的作用机制还有待进一步研究

1.检测大肠癌和配对非癌组织中全基因组lncRNA的表达谱

2.体外模拟葡萄糖限制条件寻找糖酵解相关lncrna    大肠癌糖酵解相关的lncRNA(GLCC1)

1.找出差异基因预测作生存曲线,预测疾病预后。

2.差异基因与临床分期、病理分期的关系。

3.差异基因的功能缺失实验和功能获得实验。

4.GLCC1诱导的细胞存活依赖于糖酵解代谢(细胞外酸化率(ECAR)、乳酸的产生)葡萄糖饥饿实验

           正常的细胞中转染质粒后测相关指标。

5.GLCC1与HSP90相互作用调节c-Myc的稳定性。

          将GLCC1分成好几个片段,分别看他们的作用。PCR

RNA结合蛋白免疫沉淀(RIP)检测:

6.C-Myc参与GLCC1的生物学功能

基因有/无情况下细胞的代谢 小鼠成瘤实验

7.GLCC1协调c-Myc全基因组的定位

           芯片结合高通量测序(ChIP seq)

GLCC1调节LDHA表达的机制   Real-time ChIP PCR   免疫组化

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