R语言书籍

又到了推荐R语言书籍的时候了,此次推荐的书籍部分参考@二货潜 推荐的,链接:R语言书籍
有一部分是我觉得不错的:

1. R语言语法:

[1]. 首推海爷的,这个之前我也推荐过
[2]. 其次是< advanced R> advanced R
[3]. 一些技巧性的书
[4]. 还有美国辛辛那提大学的R的基础书籍也很棒: 辛辛那提大学的R的基础书籍

[5]. 如果有需要写包的同学,可以在看下海爷的,当然还有一个文档也是介绍R包开发的: https://swsoyee.vercel.app/2021/02/writing-r-packages-a-modern-workflow-for-beginners/

[6]. 一本利用R语言进行文本挖掘,拆字符串的Text Mining with R

[7]. 还有@二货潜 推荐的: R查图的R查图大全

[8]. Practical R for Mass Communication and Journalism
链接： 链接：传送门
提取码：91f8
相信大家都有各种渠道下载它们

[9]. 还有个画热图的宝藏工具书：ComplexHeatmap

[10]. 如果对R网页感兴趣的同学不妨看下海爷的《Mastering Shiny》：
Mastering Shiny

[11] circlize

2.统计学与机器学习:

[1]. 比较基础,前线易懂
[2]. <统计学与R读书笔记>这个就更经典了,可以当成一本字典来用
[3]. 还有两本是@二货潜 推荐的,我还没有看过 https://moderndive.com/index.html

[4]. Modern Statistics for Modern Biology：Modern Statistics for Modern Biology

[5]. 有关机器学习的:
这本比较基础,基于统计的
B站也有对应的视频课：An Introduction to Statistical Learning with applications in R 视频课

[6]. 另外一本比较进阶的书是当然,熊已经在博客上将其翻译了The Elements of Statistical Learning

[7]. 最后推荐个网站,关于R 的:
R :传送门

[8]. 分析结构方程与统计的：Structural Equation Modeling in R for Ecology and Evolution

[9].生物医学统计R版：传送门

[10]. R与统计及ggplot画图：传送门

3. 有关NGS的

[1]. 生信:传送门
[2]. 还有欧老师的这本书也不错
欧老师书籍

[3]. 这本也超赞,是关于R与基因组的,里面介绍了相关基因组操作的包: Computational Genomics with R

[4]. 如果对单细胞RNA-seq感兴趣的同学，这里还有一本关于R包singleR的书
singleR
以及seurat的官方教程:
seurat官网

[5]. 以及Y叔的ggtree online的书：ggtree

[6]. 四个单细胞教程推荐:
https://scrnaseq-course.cog.sanger.ac.uk/website/index.html

https://broadinstitute.github.io/KrumlovSingleCellWorkshop2020/index.html

NBIS 2021的课程：https://nbisweden.github.io/workshop-scRNAseq/

https://www.youtube.com/c/ChipsterTutorials/videos