GEO数据集基因名转换LncRNA

GSE99416  GSE51308  GSE50710  GSE33335 GSE50710

GPL16956 GPL15314 GPL13825 GPL5175 GPL13825

做了三天,终于把这三个GEO数据集探针名对应基因名symbol。

尝试各类方法:

1.基因树的方法,洋洋洒洒几千字,但是下载R包,就无法正常安装。

2.NCBI及ENSEMBLE文件比对,无疾而终,不是代码有错误,就是需要特殊PERL文件。

3.FASTa序列入手,比对基因序列,成功将探针转化为Symbol!此处应该有掌声。

有部分数据集 依然无法转换,不过大家可以探讨,联系309739995

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