scRNA-seq | Windows下的R、RStudio下载和安装

2020/5/25，下定决心用R语言了，Python虽然顺手但是生物信息学尤其是单细胞测序领域主要还是R的天下。（发现一篇Nature communication居然用R调用了Tensorflow！说明R也可以用于深度学习）

注意下载软件的时候最好右键复制下载链接到迅雷或者其他下载器里下载，比chrome的直接下载快很多。

一、Windows下R软件的下载和安装

在官网里选择一个镜像下载适用于Windows的R软件，官网网址：

https://www.r-project.org/

图1 选择右上处的CRAN

在China中选择一个镜像，这里选择了Hong Kong。

图2 在China里选择一个镜像

选择R for Windows

图3 选择Windows版本的R

选择base下载最新版本的R，或者选择contrib选择其他版本的R，这里直接选择下载最新的4.0版本，注意软件的安装路径不能有中文。

图4 选择下载R的版本

双击.exe文件安装软件，一直点下一步就可以。

二、RStudio下载和安装

RStudio下载地址：

https://rstudio.com/products/rstudio/download/#download

选择RStudio-1.3.959.exe（for Windows）

图5 选择Rstudio for Windows

双击.exe安装，安装路径应该为全英文。

图6 安装RStudio

在安装路径下的 ./RStudio/bin/ 里可以找到rstudio.exe，选择添加快捷方式到桌面，以后就可以直接用了。

图7 添加应用程序rstudio的桌面快捷方式

RStudio的界面如图所示：

图8 RStudio

看起来RStudio是一个类似于python的pycharm的IDE，那么RStudio能否实现Pycharm的独立工程管理能力呢？

请关注下一期：scRNA-seq | 使用RStudio管理R project 。