ITK snap进行标注,python读取label

1、对ITKsnap的探索

(1)加载图片之后,画面大小可以通过按住鼠标右键拖动进行调整,左键调整画面位置。
ITK snap进行标注,python读取label_第1张图片
(2)点击“A” “S” "C"分别放大各个视图
ITK snap进行标注,python读取label_第2张图片
点击正方形框进行返回
ITK snap进行标注,python读取label_第3张图片

(3)选择标注的方式
选择勾画工具,分为画笔polygon画刷pointbrush两种

  1. 左侧为画笔按住左键勾画闭合轮廓后确认即可填实、得到目标区域; 右边为画刷
  2. 需要手动完整涂抹目标区域:按住左键涂抹、按住右键擦除。

ITK snap进行标注,python读取label_第4张图片

2 标注方式的选择

2.1 使用polygon

polygon标注有两个选项,Smooth和Polygon,推荐选用Smooth来进行拖动鼠标画取消,Polygon为给定关键点生成折线比较糙一些。画好外圈轮廓之后点击回车即可生成标注。选用一个方向的轴向图标注即可。

绘制闭合轮廓:
ITK snap进行标注,python读取label_第5张图片

ITK snap进行标注,python读取label_第6张图片
ITK snap进行标注,python读取label_第7张图片

2.2 使用brush

ITK snap进行标注,python读取label_第8张图片
ITK snap进行标注,python读取label_第9张图片
ITK snap进行标注,python读取label_第10张图片

==========还是使用brush比较合适

调整完后,切记将Active label选为你需要画的类型,将paint over恢复All labels

3 使用python显示数据,读取数据

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