10X空间转录组的文献思路简单分析

作者，追风少年i

七夕马上就要到了，古人描写七夕的诗句很多，不过小时候背的就记得一首

迢迢牵牛星，皎皎河汉女。
纤纤擢素手，札札弄机杼。
终日不成章，泣涕零如雨。
河汉清且浅，相去复几许。
盈盈一水间，脉脉不得语。

七夕啊，牛郎织女们总是让人很羡慕。

这一篇我们简单回顾10X空间转录组的分析思路和过程，上一篇说到，ST需要对基因表达、空间位置和组织学信息进行更全面和综合的考虑，所以难度上，比单细胞需要更高，对人的要求也相对高一些。

首先第一步，拿到我们的HE染色切片，我虽然分析了很多空间转录组的样本，但是发现客户自身可以对组织结构进行划分的，不得不说是凤毛麟角，以下图为例（人肺组织）：

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一张组织染色切片能够划分出功能区域，相信绝大多数人就做不到，这也是空间没有单细胞那么火的重要原因，对人的要求有点高，对生物学组织的背景要求很深，这种划分却精细越好。

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