Canoco5绘制PCA图时做对象分类

Canoco 5设置多边形和椭圆形的步骤:
1)进行排序分析后,先对物种(或样方)进行分类: 菜单栏Project-Classifications,(注意一定要所有的物种或样方进行归类,如果不归类,做图的时候将不能显示未归类的对象),然后选择Use selected classification in graphs。
2)选择Analysis-plot creation options –Genral-plot envelops for (sample or species)
3)生成排序图:Graph-Scatterplots-(sample or species)
4)选择Graph-Show Attribute Editor 或是 可以对多边形进行编辑,包括填充颜色、线条粗细等。
5)如果需要将多边形换成椭圆形:选择Edit-Setting-Graphing options- Draw envelopes as ellipses,然后点击Graph-Recreat graph, 原来排序图上的多边形将被椭圆形替代。 不过一般初始的椭圆形所设定范围不准确,这时候可以对椭圆形尺寸进行修正:鼠标左键选定要修正的椭圆形,点击右键,选择change ellipses size, 可以根据实际情况设定设定椭圆形的合适的尺寸(注意椭圆的方向和中心点不能改变,因此椭圆形效果一般比多边形差)。选择Graph-Show Attribute Editor 也可以对椭圆形进行编辑。

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