Canoco5绘制PCA图时做对象分类

Canoco 5设置多边形和椭圆形的步骤:
1)进行排序分析后，先对物种（或样方）进行分类： 菜单栏Project-Classifications，（注意一定要所有的物种或样方进行归类，如果不归类，做图的时候将不能显示未归类的对象），然后选择Use selected classification in graphs。
2)选择Analysis-plot creation options –Genral-plot envelops for (sample or species)
3)生成排序图：Graph-Scatterplots-(sample or species)
4)选择Graph-Show Attribute Editor 或是 可以对多边形进行编辑，包括填充颜色、线条粗细等。
5)如果需要将多边形换成椭圆形：选择Edit-Setting-Graphing options- Draw envelopes as ellipses，然后点击Graph-Recreat graph, 原来排序图上的多边形将被椭圆形替代。 不过一般初始的椭圆形所设定范围不准确，这时候可以对椭圆形尺寸进行修正：鼠标左键选定要修正的椭圆形，点击右键，选择change ellipses size, 可以根据实际情况设定设定椭圆形的合适的尺寸（注意椭圆的方向和中心点不能改变，因此椭圆形效果一般比多边形差）。选择Graph-Show Attribute Editor 也可以对椭圆形进行编辑。