基因富集网站—g:Profiler

推荐一个做基因富集的网站:g:Profiler
网址:https://biit.cs.ut.ee/gprofiler/gost
g:Profiler是一个用于功能丰富分析和基因列表转换的Web服务器,与最常见的DAVID相比,速度更快,界面也更友好,交互式的画面对非生信人员也很容易操作。
用法很简单,只需要在Query下输入要富集的基因list,并可以选择这个基因list是否已经根据重要性排序,选择物种,然后Run query即可。


结果图中可以通过交互式气泡图看到各个显著通路,依次点击想要的通路,气泡图会按点击顺序标记序号,并在下面显示选中的通路。


还可以进一步查看所有的通路以及对应的基因。

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参考:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6602461/

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