Linux平台使用JNI Java调用so

在做一个医疗设备的项目的时候由于涉及到心电图数据的解析，因为解析只能依靠c，所以需要java调用c生成的动态库去解析数据。
    因为用JNI调用Linux下的动态库，要求java类名和动态库中的名保持一致，所以只能通过生成一个libFileUtil.so去调用客户提供的libauto_analyse.so。

1. 确保gcc编译器已安装
2. 编写FileUtil.java 代码，用native声明需要用c实现的函数。
如果源程序是包含在package的话，应该建立同样的文件夹结构，如com/hnrbyl/rmas/util/FileUtil.java

	package com.hnrbyl.rmas.util;

public class FileUtil {
	public native static String ResultText(); 
	public static void main(String[] args) {
		System.loadLibrary("FileUtil");
		String s=FileUtil.ResultText();
		System.out.println(s);
	}

}

项目中的代码：

public class FileUtil {  
        //要调用.so中的方法  
    public native static String ResultText(String txtPath, String pdfPath);   
  
    public static String autoAnalyse(String txtPath, String pdfPath){  
        //加载自动分析已上传心电图的动态链接库文件  
        System.loadLibrary("FileUtil");  
        String jsonData = FileUtil.ResultText(txtPath, pdfPath);  
        return jsonData;  
    }  
} 

3. 在FileUtil.java文件所在目录下编译.java文件
Javac FileUtil.java

4. 编译第三步生成的.class文件，生成对应的.h头文件，本例中生成com_hnrbyl_rmas_util_FileUtil
Javah –classpath  ~workspace\elect\WebRoot\WEB-INF\classes -d d:\ -jni com.hnrbyl.rmas.util.FileUtil

其中java中各个命令的意思
-classpath <路径> 用于转入类的路径
-d <目录> 输出目录
-jni 生成JNI样式的头文件（默认）

这个Java文件是在路径“E:\workspace\elect\src”下，包“package com.hnrbyl.rmas.util;”中的
得到的FileUtil 对应的class文件，在路径“E:\workspace\elect\WebRoot\WEB-INF\classes\com\hnrbyl\rmas\util”下。

注意到以上我们命令中指定的路径
注意到我们的命令符的执行位置是源代码目录” E:\workspace\elect\src\”
-classpath  后面的路径是指包” com.hnrbyl.rmas.util”所在的根路径（如下图所示）


 

5. 第四部中生成的头文件内容

/* DO NOT EDIT THIS FILE - it is machine generated */
#include "jni.h"
/* Header for class FileUtil */

#ifndef _Included_com_hnrbyl_rmas_util_FileUtil
#define _Included_com_hnrbyl_rmas_util_FileUtil
#ifdef __cplusplus
extern "C" {
#endif
/*
* Class:     FileUtil
* Method:    ResultText
* Signature: (I)I
*/
	JNIEXPORT jstring JNICALL Java_com_hnrbyl_rmas_util_FileUtil_ResultText(JNIEnv*,
	        jobject);


#ifdef __cplusplus
}
#endif
#endif

项目中的代码：

/* DO NOT EDIT THIS FILE - it is machine generated */
#include "jni.h"
/* Header for class FileUtil */

#ifndef _Included_com_hnrbyl_rmas_util_FileUtil
#define _Included_com_hnrbyl_rmas_util_FileUtil
#ifdef __cplusplus
extern "C" {
#endif
/*
 * Class:     com_hnrbyl_rmas_util_FileUtil
 * Method:    ResultText
 * Signature: (Ljava/lang/String;Ljava/lang/String;)Ljava/lang/String;
 */
JNIEXPORT jstring JNICALL Java_com_hnrbyl_rmas_util_FileUtil_ResultText
  (JNIEnv *, jclass, jstring, jstring);


#ifdef __cplusplus
}
#endif
#endif

6. 编写FileUtil.c文件，实现引用第4步中生成的.h头文件，并声明其中的方法。

#include "jni.h"
#include "stdlib.h"
#include "FileUtil.h"
//
JNIEXPORT jstring JNICALL  Java_com_hnrbyl_rmas_util_FileUtil_ResultText(JNIEnv *env,
	jobject obj) 
	{
	char* str = "Hello World！"; 
	jstring rtn;
	rtn = env->NewStringUTF(str);
	return rtn;
	}

项目中的代码：

#include "stdlib.h"
#include "stdio.h"
#include "FileUtil.h"
#include "dlfcn.h"
#include "jni.h"
JNIEXPORT jstring JNICALL  Java_com_hnrbyl_rmas_util_FileUtil_ResultText
  (JNIEnv *env,	jobject obj, jstring txtPath, jstring pdfPath) 
	{
	   char** (*myso)(char* a, char* b);//function pointer   
	   void *handle; 
	   char *errorInfo;
	   handle=dlopen("libauto_analyse.so",RTLD_LAZY);//open lib file   
	   errorInfo = dlerror();
	   // 如果返回 NULL 句柄，表示无法找到对象文件，过程结束。否则的话，将会得到对象的一个句柄，可以进一步询问对象
	   if (errorInfo){
           // 如果返回 NULL 句柄,通过dlerror方法可以取得无法访问对象的原因
           printf("Open Error:%s.\n",dlerror());
           return 0;
	   }
	   // 使用 dlsym 函数，尝试解析新打开的对象文件中的符号。您将会得到一个有效的指向该符号的指针，或者是得到一个 NULL 并返回一个错误
	   myso=dlsym(handle,"auto_analyse");//call dlsym function  
	   errorInfo = dlerror();// 调用dlerror方法，返回错误信息的同时，内存中的错误信息被清空	   
	   if (errorInfo){
           printf("Dlsym Error:%s.\n",errorInfo);
           return 1;
       }
	   char* a=(*env)->GetStringUTFChars(env, txtPath, 0);
	   char* b=(*env)->GetStringUTFChars(env, pdfPath, 0);
	   char **str=(*myso)(a,b);   
	   dlclose(handle);  
	   (*env)->ReleaseStringUTFChars(env, txtPath, a);
	   (*env)->ReleaseStringUTFChars(env, pdfPath, b);
	   jstring rtn;
	   rtn = (*env)->NewStringUTF(env,str[1]);
	   return rtn;
	}

7. 讲第6步中编写的FileUtil.c文件，编译成.so文件
gcc -I/wenjin/jdk1.7.0_25/include/ -I/wenjin/jdk1.7.0_25/include/linux/ -fPIC -shared -o libFileUtil.so FileUtil.c
注:/ wenjin/jdk1.7.0_25/include 是jni.h头文件所在的路径
/ wenjin/jdk1.7.0_25/include/linux 是jni_md.h所在的路径

8. 将第7步中生成的libFileUtil.so文件拷贝到java的加载库LD_LIBRARY_PATH指向的路径中。
9. 在运行FileUtil.class
在com.hnrbyl.rmas.util跟目录src下运行
Java com.hnrbyl.rmas.util.FileUtil

一切正常后，可以看到运行結果是输出了Hello World!，其值是由C语言代码实现并返回的。






gcc -I/usr/java/jdk1.7.0_25/include/ -I/usr/java/jdk1.7.0_25/include/linux/ -lauto_analyse -lhpdf -lz -lm -ljson-c -fPIC -shared -o libFileUtil.so FileUtil.c

执行该句的问题。
问题：
/usr/bin/ld: /usr/local/lib/libz.a(crc32.o): relocation R_X86_64_32 against `a local symbol' can not be used when making a shared object; recompile with -fPIC
/usr/local/lib/libz.a: could not read symbols: Bad value
一般是64 位 电脑才会出现。

解决方法如下：
cd zlib-1.2.3 //进入zlib目录

CFLAGS="-O3 -fPIC" ./configure   //使用64位元的方法进行编译

make

make install

make clean