字符串匹配-BNDM算法

1、BNDM算法与BDM相似，它维护一个集合，即位向量D=Dm....D1,用这个位向量的位记录u在P的反转串中的所有出现位置(因为D的构造是从Dm到D1,不是从D1到Dm,所以用反转)，用这种并行算法代替后缀自动机来识别模式串的子串。如果子串Pj....P(j+|u|+1)等于u,那么D的第m-j+1位是1，表示p的位置j是一个活动状态。

2、当读入一个新的文本字符σ时，要从D更新到D'，D'的活动状态j对应于σu在模式串的起始位置:

1)u出现在模式串的位置j+1，D的j+1位活动

2）σ在模式串的j位出现.

3、BNDM方法预先计算表B，B的每个元素代表了每个字符的位向量。

D的更新方式分以下2步：

1）D1'<-D&B[σ]

2)D'<-D1<<1

以上方法先检查匹配，再移位，因为D预置为每位全是1

3、代码

4、例子

模式串P=ATATA，文本串=AGATACGATATATAC

1）P的反转串=ATATA

2）表B

A ：10101 （如右边的A在右边起第1位，所以在最左边的第1位）

T ：01010

* ：00000

D = 11111

3)在窗口中从后向前读入文本中的字符

[AGATA]CGATATATAC:

(last=5,j>0)

11111&10101->10101

(Dm=1=>last=4,j>0)

01010&01010->01010

10100&10101->10100

(Dm=1=>last=2,j>0)

01000&00000->00000

4)D全0=>pos=pos+last=pos+2，D全置1

AG[ATACG]ATATATAC:

(last=5,j>0)

11111&00000->00000

5)D全0=>pos=pos+last=pos+5，D全置1

AGATACG[ATATA]TAC:

(last=5,j>0)

11111&10101->10101

(Dm=1=>last=4,j>0)

01010&01010->01010

10100&10101->10100

(Dm=1=>last=2,j>0)

01000&01010->01000

10000&10101->10000

(Dm=1,j=0=>匹配成功)

6)D全0=>pos=pos+last=pos+2，D全置1

AGATACGAT[ATATA]C:

(last=5,j>0)

11111&10101->10101

(last=4,j>0)

01010&01010->01010

10100&10101->10100

(last=2,j>0)

010000&01010->01000

10000&10101->10000

(Dm=1,j=0=>匹配成功)

7)pos>n-m，结束