浅测TokuDB

一. 计划:

TokuDB文档描述其具备的高insert性能、高压缩比、hot schema changes等特性较符合日志类项目的应用场景,耳听眼见终是虚,实测是必须的。

目前TokuDB仅支持MySQL5.5.x与MariaDB5.5.x,相比较之下Percona的支持要好很多,但仍然需要分开下载进行安装。此次的测试内容:MySQL5.6.22(innoDB) Vs. TokuDB for Percona5.6.22。

1. 软硬件环境信息:

虚拟机 ********
CPU
CPUX5660  @ 2.80GHz
逻辑CPU个数 4
内存 4G
系统 Red Hat Enterprise Linux Server release 6.1 (Santiago)
内核 2.6.32-131.0.15.el6.x86_64
IO调度 none
文件系统 ext4

2. Linux下简单的物理IO测速:

[ming.liu@mydbprod52 ~]$ time dd
if=/dev/zero of=test.dbf bs=8k count=600000 oflag=direct
600000+0 records in
600000+0 records
out
4915200000 bytes
(4.9 GB) copied, 381.327 s, 12.9 MB/s
 
real    6m21.335s
user    0m0.292s
sys     0m12.690s

二.  DB安装

1. MySQL5.6.22环境准备

1). DB Config

innodb_buffer_pool_size = 3000M

2). Installing MySQL(略)

[root@mydbprod52 ~]# /etc/init.d/mysqld start

2. Pecona5.6.22 and TokuDB环境准备

    1). Prerequisites

详见手册9.2.1

安装Jemalloc:

[root@mydbprod52 ~]# wget http://www.canonware.com/download/jemalloc/jemalloc-3.6.0.tar.bz2
[root@mydbprod52 ~]# tar xjf jemalloc-3.6.0.tar.bz2 
[root@mydbprod52 ~]# cd jemalloc-3.6.0
[root@mydbprod52 ~]# ./configure
[root@mydbprod52 ~]# make && make install
[root@mydbprod52 ~]# echo '/usr/local/lib' > /etc/ld.so.conf.d/local.conf
[root@mydbprod52 ~]# ldconfig

    2). DB Config

	tokudb_cache_size = 3G
	tokudb_directio = ON
	tokudb_row_format = tokudb_fast
	tokudb_write_status_frequency = 1
	tokudb_read_status_frequency = 1

    3). Installing Percona(安装部分略)

[root@mydbprod52 ~]# /etc/init.d/perconad start

    4). Installing TokuDB Plugin

mysql> INSTALL PLUGIN TokuDB SONAME 'ha_tokudb.so';
ERROR 1123 (HY000): Can't initialize function 'TokuDB'; Plugin initialization function failed.

        4.1). troubleshooting

[root@mydbprod52 ~]# vi data/wifimydb01prod.err 
Version: '5.6.22-71.0'  socket: '/tmp/mysql.sock'  port: 3306  Percona Server (GPL), Release 71.0, Revision 726
Transparent huge pages are enabled, according to /sys/kernel/mm/redhat_transparent_hugepage/enabled
2015-01-22 18:44:50 11824 [ERROR] TokuDB: Huge pages are enabled, disable them before continuing

2015-01-22 18:44:50 11824 [ERROR] ************************************************************
2015-01-22 18:44:50 11824 [ERROR]
2015-01-22 18:44:50 11824 [ERROR]                         @@@@@@@@@@@
2015-01-22 18:44:50 11824 [ERROR]                       @@'         '@@
2015-01-22 18:44:50 11824 [ERROR]                      @@    _     _  @@
2015-01-22 18:44:50 11824 [ERROR]                      |    (.)   (.)  |
2015-01-22 18:44:50 11824 [ERROR]                      |             ` |
2015-01-22 18:44:50 11824 [ERROR]                      |        >    ' |
2015-01-22 18:44:50 11824 [ERROR]                      |     .----.    |
2015-01-22 18:44:50 11824 [ERROR]                      ..   |.----.|  ..
2015-01-22 18:44:50 11824 [ERROR]                       ..  '      ' ..
2015-01-22 18:44:50 11824 [ERROR]                         .._______,.
2015-01-22 18:44:50 11824 [ERROR]
2015-01-22 18:44:50 11824 [ERROR] TokuDB will not run with transparent huge pages enabled.
2015-01-22 18:44:50 11824 [ERROR] Please disable them to continue.
2015-01-22 18:44:50 11824 [ERROR] (echo never > /sys/kernel/mm/transparent_hugepage/enabled)
2015-01-22 18:44:50 11824 [ERROR]
2015-01-22 18:44:50 11824 [ERROR] ************************************************************
2015-01-22 18:44:50 11824 [ERROR] Plugin 'TokuDB' init function returned error.
2015-01-22 18:44:50 11824 [ERROR] Plugin 'TokuDB' registration as a STORAGE ENGINE failed.
2015-01-22 18:44:50 11824 [Note] Shutting down plugin 'TokuDB'
......

[root@mydbprod52 ~]# vi /etc/rc.local
echo never > /sys/kernel/mm/redhat_transparent_hugepage/defrag
echo never > /sys/kernel/mm/redhat_transparent_hugepage/enabled

mysql> INSTALL PLUGIN TokuDB SONAME 'ha_tokudb.so';
Query OK, 0 rows affected (0.12 sec)

mysql> INSTALL PLUGIN tokudb_file_map SONAME 'ha_tokudb.so';
Query OK, 0 rows affected (0.00 sec)

mysql> INSTALL PLUGIN tokudb_fractal_tree_info SONAME 'ha_tokudb.so';
Query OK, 0 rows affected (0.00 sec)

mysql> INSTALL PLUGIN tokudb_fractal_tree_block_map SONAME 'ha_tokudb.so';
Query OK, 0 rows affected (0.00 sec)

mysql> INSTALL PLUGIN tokudb_trx SONAME 'ha_tokudb.so';
Query OK, 0 rows affected (0.00 sec)

mysql> INSTALL PLUGIN tokudb_locks SONAME 'ha_tokudb.so';
Query OK, 0 rows affected (0.00 sec)

mysql> INSTALL PLUGIN tokudb_lock_waits SONAME 'ha_tokudb.so';
Query OK, 0 rows affected (0.00 sec)

mysql> SET GLOBAL default_storage_engine=TokuDB;
Query OK, 0 rows affected (0.00 sec)

 三. 基测工具准备

    3.1) Installing Sysbench

[root@mydbprod52 ~]# git clone https://github.com/zatrazz/sysbench.git
[root@mydbprod52 ~]# ./autogen.sh
[root@mydbprod52 ~]# ./configure --prefix=/usr/local/sysbench --with-mysql-includes=/usr/local/mysql/include --with-mysql-libs=/usr/local/mysql/lib
[root@mydbprod52 ~]# make && make install
[ming.liu@mydbprod52 ~]$ export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/mysql/lib
[ming.liu@mydbprod52 ~]$ /usr/local/sysbench/bin/sysbench --help

    3.2) Installing Gnuplot 

[root@mydbprod52 ~]# yum install gnuplot

四. 测试

    4.1) INSERT( innodb单表)测试

        a) 测试脚本

[ming.liu@mydbprod52 ~]$ /usr/local/sysbench/bin/sysbench --test=/home/ming.liu/sysbench/sysbench/tests/db/insert.lua --mysql-host=localhost --mysql-port=3306 --mysql-user=ming --mysql-password=ming --mysql-db=sbtest4 --num-threads=1 --oltp-tables-count=1 --mysql-table-engine=innodb --oltp-table-size=100000000 prepare

[ming.liu@mydbprod52 ~]$ time for i in 1 2 4 8 16 32 64 128; do /usr/local/sysbench/bin/sysbench --test=/home/ming.liu/sysbench/sysbench/tests/db/insert.lua --mysql-table-engine=innodb --mysql-host=localhost --mysql-port=3306 --mysql-user=ming --mysql-password=ming --mysql-db=sbtest4 --oltp_tables_count=1 --oltp-table-size=100000000 --rand-init=on --num-threads=${i} --oltp-read-only=off  --rand-type=uniform --max-time=360 --max-requests=0 --percentile=99 run >> sysbench_test_insert_InnoDB.log ; done

        b) 绘图

[ming.liu@mydbprod52 ~]$ cat sysbench_test_insert_innodb.log | egrep " cat|threads:|read/write requests:" | tr -d "\n" | sed 's/Number of threads: /\n/g' | sed 's/\[/\n/g' | sed 's/[A-Za-z\/]\{1,\}://g'| sed 's/ \.//g' | awk '{print $1 $4}' | sed 's/(/\t/g' > sysbench_test_insert_innoDB.csv

[ming.liu@mydbprod52 ~]$ vi innodb_insert_mygraph
# output as png image
set terminal png
 
# save file to "benchmark.png"
set output "sysbench_test_insert_InnoDB_benchmark.png"
 
# graph title
set title "Benchmark for Sysbench"
 
# aspect ratio for image size
set size 1,1
 
# enable grid on y and x axis
set grid y
set grid x
 
# x-axis label
set xlabel "Threads"
 
# y-axis label
set ylabel "read/write(Insert) per sec."
 
# plot data from sysbench.csv

plot "sysbench_test_insert_innoDB.csv" using (log($1)):2:xtic(1) with linesp notitle

[ming.liu@mydbprod52 ~]$ gnuplot innodb_insert_mygraph

        c) 图示

浅测TokuDB

    4.2) INSERT( tokudb单表)测试

        a) 测试脚本

[ming.liu@mydbprod52 ~]$ /usr/local/sysbench/bin/sysbench --test=/home/ming.liu/sysbench/sysbench/tests/db/insert.lua --mysql-host=localhost --mysql-port=3306 --mysql-user=ming --mysql-password=ming --mysql-db=sbtest2 --num-threads=1 --oltp-tables-count=1 --mysql-table-engine=tokudb --oltp-table-size=100000000 prepare

[ming.liu@mydbprod52 ~]$ time for i in 1 2 4 8 16 32 64 128; do /usr/local/sysbench/bin/sysbench --test=/home/ming.liu/sysbench/sysbench/tests/db/insert.lua --mysql-table-engine=tokudb --mysql-host=localhost --mysql-port=3306 --mysql-user=ming --mysql-password=ming --mysql-db=sbtest2 --oltp_tables_count=1 --oltp-table-size=100000000 --rand-init=on --num-threads=${i} --oltp-read-only=off  --rand-type=uniform --max-time=360 --max-requests=0 --percentile=99 run >> sysbench_test_insert_tokudb.log ; done

        b) 绘图

[ming.liu@mydbprod52 ~]$ vi tokudb_insert_mygraph
# output as png image
set terminal png
 
# save file to "benchmark.png"
set output "sysbench_test_insert_tokuDB_benchmark.png"
 
# graph title
set title "Benchmark for Sysbench"
 
# aspect ratio for image size
set size 1,1
 
# enable grid on y and x axis
set grid y
set grid x
 
# x-axis label
set xlabel "Threads"
 
# y-axis label
set ylabel "read/write(Insert) per sec."
 
# plot data from sysbench.csv

plot "sysbench_test_insert_tokuDB.csv" using (log($1)):2:xtic(1) with linesp notitle

        c1) 图示1(参数 tokudb_directio = ON

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        c2) 图示2(参数 tokudb_directio = OFF

浅测TokuDB

5. 测试小结

1. TokuDB在写操作(Insert)的表现优于InnoDB,在并发增长的情况下表现亦优于InnoDB。

2. 在此次实际测试中,InnoDB峰值约为11000 per sec,TokuDB峰值约为15000 per sec,并发超过4以后,性能均有不同程度的下降。

3. 在数据压缩方面,同时生成2千万行数据,TokuDB表大小约为3.1G,InnoDB表大小约为4.8G。这里需说明的是测试中TokuDB所启用的压缩选项为’fast’,而InnoDB未启用压缩。InnoDB也具有压缩功能,只不过压缩行为是TokuDB的默认行为。在本文测试中并未使用InnoDB的压缩格式。

4. 对测试造成的影响的问题因素:1. 共享存储的IO控制与争用对测试过程的影响。

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