- 2025.07.04【转录组】| RNA-seq 组装“瘦身术”——BBNorm 归一化处理
穆易青
组装RNA-seq二代大数据
作者:穆易青|CSDN原创当你的RNA-seq原始读长文件动辄数百GB,组装器张口就要500GB+内存时,该怎么办?一种最经济、又几乎不丢掉有用信息的做法就是——数字归一化(DigitalNormalization)。本文将带你认识BBTools套件中的利器BBNorm,并手把手完成一次上百TB级别数据的“瘦身”实践。文章目录1.什么是数字归一化?2.BBNorm:BBTools家族中的“减肥大师
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1.什么是序列搜索和比对工具?序列搜索和比对工具在生物信息学中用于在大型序列数据库中搜索与查询序列相似的序列,并进行比对分析。这些工具可以帮助研究人员识别与目标序列相关的已知序列,从而推测其功能、结构和进化关系。常见的序列搜索和比对工具包括:BLAST(BasicLocalAlignmentSearchTool):最常用的序列搜索工具,能够快速找到与查询序列相似的序列。FASTA:另一个常用的序列
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引擎好比就是一个发动机。Selenium是没有关于测试用例和测试套件管理和执行的模块。我们需要借助第三方单元测试框架来实现用例管理和用例的执行。例如Java中有Junit或者testNG,Python中有unittest单元测试框架。4.Seleinum是否有读取excel文件的库没有,这里需要用到第三方工具。例如ApachePOI插件。5.Selenium有哪些组件?最早的有SeleniumID
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使用Python在Windows和Linux环境中实现DOCX转PDF的需求,在Windows上,可以使用docx2pdf库实现DOCX转PDF,而在Linux上,可以使用libreoffice软件来实现,因为linux实现word转pdf并没有直接可依赖的模块,需要依赖word解析软件,综合权衡选择了libreoffice。LibreOffice简介LibreOffice(自由办公套件)是一款自
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DevExtreme拥有高性能的HTML5/JavaScript小部件集合,使您可以利用现代Web开发堆栈(包括React,Angular,ASP.NETCore,jQuery,Knockout等)构建交互式的Web应用程序。从Angular和Reac,到ASP.NETCore或Vue,DevExtreme包含高性能和响应式UI小部件集合,可在传统Web和下一代移动应用程序中使用。该套件附带功能齐
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TrinamicTMC2209-EVAL-KIT评估套件可结合TRINAMIC评估板系统或作为独立评估板对TMC2209电动机驱动器进行评估。TMC2209评估套件包括三部分,分别是LANDUNGSBRüCKE(MCU板),ESELSBRüCKE(具有多个测试点和独立设置的连接器板)和TMC2209-EVAL驱动器板。通过此设置,可以快速轻松地开始访问所有寄存器并具有全部功能/诊断功能。TMC22
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作为微软Office套件中的核心组件,Word是日常办公和学习中最常用的文字处理软件。掌握Word的快捷键可以大幅提升工作效率,减少鼠标操作时间。本文将全面整理Word中最实用、最高频的Ctrl组合快捷键,帮助您成为Word操作高手。基础编辑快捷键Ctrl+C-复制选中的文本或对象Ctrl+X-剪切选中的文本或对象Ctrl+V-粘贴剪贴板内容Ctrl+Z-撤销上一步操作(可多次撤销)Ctrl+Y-
- 雷电模拟器安装 KitsuneMagisk (原 Magisk-delta)
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在2025年,Magiskdelta这个分支的安装可能有极强的时效性,因为仓库的重要维护者弃坑/没时间精力,最佳实践随时会变前情提要Magisk(也被称为“面具”)是一款针对安卓设备的开源自定义工具套件,它能在不直接修改系统文件的情况下获取Root权限,并通过模块系统对设备进行各种自定义修改。此外,Magisk还具备隐藏自身(MagiskHide)的功能,使得用户在获取Root权限的同时也能正常使
- 群晖NAS服务器部署PHP项目
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1:服务器访问地址,用户名,密码登录2:安装apache,MariaDB10,phpMyAdmin,Webstation,PHP7.43:群晖官方套件需要通过本地公网IP地址映射(本地需要有公网IP地址)4:路由器做好端口映射(443和80以及一些常用的端口公网都是封禁的),需要自行映射其它端口5:给文件夹runtime赋权限,右键选择属性–权限,新增一个Everyone的权限给读写权限6:配置a
- QT连接MySQL数据库(安装驱动及测试)
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1、原因QT6及其以上版本基本不在提供MySQL的驱动,因此要自己安装驱动文件,并与MySQL建立连接。2、使用版本要匹配数据库和QT都是相同位(如都是64位)的编译器下载的驱动的版本号和编译器要与QT版本及编译器器相同查看QT版本号和编译器:项目-->Debug-->构建套件本例版本号:6.4.3本例编译器:MSVC2019_64bit一般QTcreator的编译器为MinGW_11.2.0_6
- 国内少有的Flutter干货分享:Flutter的原理及美团的实践!
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Flutter是Google开发的一套全新的跨平台、开源UI框架,支持iOS、Android系统开发,并且是未来新操作系统Fuchsia的默认开发套件。自从2017年5月发布第一个版本以来,目前Flutter已经发布了近60个版本,并且在2018年5月发布了第一个“ReadyforProductionApps”的Beta3版本,6月20日发布了第一个“ReleasePreview”版本。初识Flu
- 【习题】HarmonyOS介绍
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Harmonyosharmonyos华为
判断题1.“一次开发,多端部署”指的是一个工程,一次开发上架,多端按需部署。为了实现这一目的,HarmonyOS提供了多端开发环境,多端开发能力以及多端分发机制。正确(True)错误(False)正确答案:正确(True)2.《鸿蒙生态应用开发白皮书》全面阐释了鸿蒙生态下应用开发核心理念、关键能力以及创新体验,旨在帮助开发者快速、准确、全面的了解鸿蒙开发套件给开发者提供的能力全景和未来的愿景。正确
- java杨辉三角
3213213333332132
java基础
package com.algorithm;
/**
* @Description 杨辉三角
* @author FuJianyong
* 2015-1-22上午10:10:59
*/
public class YangHui {
public static void main(String[] args) {
//初始化二维数组长度
int[][] y
- 《大话重构》之大布局的辛酸历史
白糖_
重构
《大话重构》中提到“大布局你伤不起”,如果企图重构一个陈旧的大型系统是有非常大的风险,重构不是想象中那么简单。我目前所在公司正好对产品做了一次“大布局重构”,下面我就分享这个“大布局”项目经验给大家。
背景
公司专注于企业级管理产品软件,企业有大中小之分,在2000年初公司用JSP/Servlet开发了一套针对中
- 电驴链接在线视频播放源码
dubinwei
源码电驴播放器视频ed2k
本项目是个搜索电驴(ed2k)链接的应用,借助于磁力视频播放器(官网:
http://loveandroid.duapp.com/ 开放平台),可以实现在线播放视频,也可以用迅雷或者其他下载工具下载。
项目源码:
http://git.oschina.net/svo/Emule,动态更新。也可从附件中下载。
项目源码依赖于两个库项目,库项目一链接:
http://git.oschina.
- Javascript中函数的toString()方法
周凡杨
JavaScriptjstoStringfunctionobject
简述
The toString() method returns a string representing the source code of the function.
简译之,Javascript的toString()方法返回一个代表函数源代码的字符串。
句法
function.
- struts处理自定义异常
g21121
struts
很多时候我们会用到自定义异常来表示特定的错误情况,自定义异常比较简单,只要分清是运行时异常还是非运行时异常即可,运行时异常不需要捕获,继承自RuntimeException,是由容器自己抛出,例如空指针异常。
非运行时异常继承自Exception,在抛出后需要捕获,例如文件未找到异常。
此处我们用的是非运行时异常,首先定义一个异常LoginException:
/**
* 类描述:登录相
- Linux中find常见用法示例
510888780
linux
Linux中find常见用法示例
·find path -option [ -print ] [ -exec -ok command ] {} \;
find命令的参数;
- SpringMVC的各种参数绑定方式
Harry642
springMVC绑定表单
1. 基本数据类型(以int为例,其他类似):
Controller代码:
@RequestMapping("saysth.do")
public void test(int count) {
}
表单代码:
<form action="saysth.do" method="post&q
- Java 获取Oracle ROWID
aijuans
javaoracle
A ROWID is an identification tag unique for each row of an Oracle Database table. The ROWID can be thought of as a virtual column, containing the ID for each row.
The oracle.sql.ROWID class i
- java获取方法的参数名
antlove
javajdkparametermethodreflect
reflect.ClassInformationUtil.java
package reflect;
import javassist.ClassPool;
import javassist.CtClass;
import javassist.CtMethod;
import javassist.Modifier;
import javassist.bytecode.CodeAtt
- JAVA正则表达式匹配 查找 替换 提取操作
百合不是茶
java正则表达式替换提取查找
正则表达式的查找;主要是用到String类中的split();
String str;
str.split();方法中传入按照什么规则截取,返回一个String数组
常见的截取规则:
str.split("\\.")按照.来截取
str.
- Java中equals()与hashCode()方法详解
bijian1013
javasetequals()hashCode()
一.equals()方法详解
equals()方法在object类中定义如下:
public boolean equals(Object obj) {
return (this == obj);
}
很明显是对两个对象的地址值进行的比较(即比较引用是否相同)。但是我们知道,String 、Math、I
- 精通Oracle10编程SQL(4)使用SQL语句
bijian1013
oracle数据库plsql
--工资级别表
create table SALGRADE
(
GRADE NUMBER(10),
LOSAL NUMBER(10,2),
HISAL NUMBER(10,2)
)
insert into SALGRADE values(1,0,100);
insert into SALGRADE values(2,100,200);
inser
- 【Nginx二】Nginx作为静态文件HTTP服务器
bit1129
HTTP服务器
Nginx作为静态文件HTTP服务器
在本地系统中创建/data/www目录,存放html文件(包括index.html)
创建/data/images目录,存放imags图片
在主配置文件中添加http指令
http {
server {
listen 80;
server_name
- kafka获得最新partition offset
blackproof
kafkapartitionoffset最新
kafka获得partition下标,需要用到kafka的simpleconsumer
import java.util.ArrayList;
import java.util.Collections;
import java.util.Date;
import java.util.HashMap;
import java.util.List;
import java.
- centos 7安装docker两种方式
ronin47
第一种是采用yum 方式
yum install -y docker
 
- java-60-在O(1)时间删除链表结点
bylijinnan
java
public class DeleteNode_O1_Time {
/**
* Q 60 在O(1)时间删除链表结点
* 给定链表的头指针和一个结点指针(!!),在O(1)时间删除该结点
*
* Assume the list is:
* head->...->nodeToDelete->mNode->nNode->..
- nginx利用proxy_cache来缓存文件
cfyme
cache
user zhangy users;
worker_processes 10;
error_log /var/vlogs/nginx_error.log crit;
pid /var/vlogs/nginx.pid;
#Specifies the value for ma
- [JWFD开源工作流]JWFD嵌入式语法分析器负号的使用问题
comsci
嵌入式
假如我们需要用JWFD的语法分析模块定义一个带负号的方程式,直接在方程式之前添加负号是不正确的,而必须这样做:
string str01 = "a=3.14;b=2.71;c=0;c-((a*a)+(b*b))"
定义一个0整数c,然后用这个整数c去
- 如何集成支付宝官方文档
dai_lm
android
官方文档下载地址
https://b.alipay.com/order/productDetail.htm?productId=2012120700377310&tabId=4#ps-tabinfo-hash
集成的必要条件
1. 需要有自己的Server接收支付宝的消息
2. 需要先制作app,然后提交支付宝审核,通过后才能集成
调试的时候估计会真的扣款,请注意
- 应该在什么时候使用Hadoop
datamachine
hadoop
原帖地址:http://blog.chinaunix.net/uid-301743-id-3925358.html
存档,某些观点与我不谋而合,过度技术化不可取,且hadoop并非万能。
--------------------------------------------万能的分割线--------------------------------
有人问我,“你在大数据和Hado
- 在GridView中对于有外键的字段使用关联模型进行搜索和排序
dcj3sjt126com
yii
在GridView中使用关联模型进行搜索和排序
首先我们有两个模型它们直接有关联:
class Author extends CActiveRecord {
...
}
class Post extends CActiveRecord {
...
function relations() {
return array(
'
- 使用NSString 的格式化大全
dcj3sjt126com
Objective-C
格式定义The format specifiers supported by the NSString formatting methods and CFString formatting functions follow the IEEE printf specification; the specifiers are summarized in Table 1. Note that you c
- 使用activeX插件对象object滚动有重影
蕃薯耀
activeX插件滚动有重影
使用activeX插件对象object滚动有重影 <object style="width:0;" id="abc" classid="CLSID:D3E3970F-2927-9680-BBB4-5D0889909DF6" codebase="activex/OAX339.CAB#
- SpringMVC4零配置
hanqunfeng
springmvc4
基于Servlet3.0规范和SpringMVC4注解式配置方式,实现零xml配置,弄了个小demo,供交流讨论。
项目说明如下:
1.db.sql是项目中用到的表,数据库使用的是oracle11g
2.该项目使用mvn进行管理,私服为自搭建nexus,项目只用到一个第三方 jar,就是oracle的驱动;
3.默认项目为零配置启动,如果需要更改启动方式,请
- 《开源框架那点事儿16》:缓存相关代码的演变
j2eetop
开源框架
问题引入
上次我参与某个大型项目的优化工作,由于系统要求有比较高的TPS,因此就免不了要使用缓冲。
该项目中用的缓冲比较多,有MemCache,有Redis,有的还需要提供二级缓冲,也就是说应用服务器这层也可以设置一些缓冲。
当然去看相关实现代代码的时候,大致是下面的样子。
[java]
view plain
copy
print
?
public vo
- AngularJS浅析
kvhur
JavaScript
概念
AngularJS is a structural framework for dynamic web apps.
了解更多详情请见原文链接:http://www.gbtags.com/gb/share/5726.htm
Directive
扩展html,给html添加声明语句,以便实现自己的需求。对于页面中html元素以ng为前缀的属性名称,ng是angular的命名空间
- 架构师之jdk的bug排查(一)---------------split的点号陷阱
nannan408
split
1.前言.
jdk1.6的lang包的split方法是有bug的,它不能有效识别A.b.c这种类型,导致截取长度始终是0.而对于其他字符,则无此问题.不知道官方有没有修复这个bug.
2.代码
String[] paths = "object.object2.prop11".split("'");
System.ou
- 如何对10亿数据量级的mongoDB作高效的全表扫描
quentinXXZ
mongodb
本文链接:
http://quentinXXZ.iteye.com/blog/2149440
一、正常情况下,不应该有这种需求
首先,大家应该有个概念,标题中的这个问题,在大多情况下是一个伪命题,不应该被提出来。要知道,对于一般较大数据量的数据库,全表查询,这种操作一般情况下是不应该出现的,在做正常查询的时候,如果是范围查询,你至少应该要加上limit。
说一下,
- C语言算法之水仙花数
qiufeihu
c算法
/**
* 水仙花数
*/
#include <stdio.h>
#define N 10
int main()
{
int x,y,z;
for(x=1;x<=N;x++)
for(y=0;y<=N;y++)
for(z=0;z<=N;z++)
if(x*100+y*10+z == x*x*x
- JSP指令
wyzuomumu
jsp
jsp指令的一般语法格式: <%@ 指令名 属性 =”值 ” %>
常用的三种指令: page,include,taglib
page指令语法形式: <%@ page 属性 1=”值 1” 属性 2=”值 2”%>
include指令语法形式: <%@include file=”relative url”%> (jsp可以通过 include