openMPI配置

在所有的节点上，做下面的1—3操作

1，安装openmpi

http://www.open-mpi.org/software/ompi/v1.6/

之前系统默认带有openMPI，先把旧的删掉

2，配置无密码ssh登录：
请参考： 如何配置无密码SSH

3，在工作目录下编制配置文件(文件名随意)，内容包括所有节点的名称，例如：
#>cat hosts
host1 slots=4
host2 slots=4
host3 slots=4
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所有节点上的工作目录必需相同，配置文件名和内容也必需相同，简单的办法是所有节点的工作目录都mount到同一个nfs输出上
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在主节点上写程序并编译执行4—8
4，例子程序：
[root@dhcp-beijing-cdc-10-182-120-155 ~]# cat hello.c
#include
#include "mpi.h"

int main(int argc, char *argv[])
{
int nproc;
int iproc;
char proc_name[MPI_MAX_PROCESSOR_NAME];
int nameLength;
MPI_Init(&argc,&argv);
MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD,&nproc);
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD,&iproc);

MPI_Get_processor_name(proc_name,&nameLength);
printf("Hello World, Iam host %s with rank %d of %d\n", proc_name,iproc,nproc);

MPI_Finalize();

return 0;
}

5，编译这个例子：
mpicc -o hello hello.c

6，拷贝可执行文件hello到所有节点的相同工作目录（如果使用nfs可忽略此步）

7，执行hello
#> mpirun -np 2 hello -hostfiles hosts

mpirun -hostfile ./hosts ./hello_cxx

(上面的数字2代表在两个节点上运行hello)

此时，是不是已经看到了来自其它节点的问候？

8，当然，你可以用其他命令来替换hello比如：
#> mpirun -np 3 ls -hostfiles hosts
此命令在各节点上执行ls操作，并显示结果在主节点上。